Difference between revisions of "Team:William and Mary/Parts"

(Prototype team page)
 
Line 1: Line 1:
−
{{William_and_Mary}}
 
−
<html>
 
  
−
<h2> Part Documentation</h2>
+
<html lang="en">
 +
<cfheader name="X-XSS-Protection" value="1">
 +
    <head>
 +
        <meta charset="utf-8" />
 +
<link rel="icon" type="image/png" href="https://static.igem.org/mediawiki/2015/e/ea/WMFavicon.png">
  
−
<p>Each team will make new parts during iGEM and will submit them to the Registry of Standard Biological Parts. The iGEM software provides an easy way to present the parts your team has created. The <code>&lt;groupparts&gt;</code> tag (see below) will generate a table with all of the parts that your team adds to your team sandbox.</p>
+
        <meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge,chrome=1" />
−
<p>Remember that the goal of proper part documentation is to describe and define a part, so that it can be used without needing to refer to the primary literature. Registry users in future years should be able to read your documentation and be able to use the part successfully. Also, you should provide proper references to acknowledge previous authors and to provide for users who wish to know more.</p>
+
        <title>NOISE - W&M iGEM</title>
 +
        <meta content='width=device-width, initial-scale=1.0, maximum-scale=1.0, user-scalable=0' name='viewport' />
 +
        <link href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/bootstrap?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
<link href="https://2015.igem.org/Team:Stockholm/fixbootstrap?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
        <link href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/rubick?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
        <link href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/demo?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
        <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2015.igem.org/Template:William_and_Mary/jquerybxsliderCSS?action=raw&ctype=text/css" />
  
 +
        <!--    Fonts and icons    -->
 +
        <link href="http://maxcdn.bootstrapcdn.com/font-awesome/4.2.0/css/font-awesome.min.css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
        <link href='http://fonts.googleapis.com/css?family=Droid+Serif:400,700' rel='stylesheet' type='text/css'>
 +
        <link href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/pe-icon-7-stroke?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
        <link href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Rubik-Fonts?action=raw&amp;ctype=text/css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
 +
       
 +
<!-- the wiki settings in the section immediately below are from UC San Diego 2015 -->
 +
        <style type="text/css">
 +
/* WIKI SETTINGS*/
 +
 +
/* Hide first heading */
 +
.firstHeading {
 +
display: none;
 +
}
 +
 +
/*-- Remove borders, float content left and remove padding/margin */
 +
#globalWrapper, #content{
 +
background-color: transparent;
 +
border: none;
 +
float: center;
 +
                                width: 101%;
 +
margin-left: -3px;
 +
margin-top: -8px;
 +
padding: auto;
 +
}
  
−
<div class="highlightBox">
+
/*left align Black Menu Bar */
−
<h4>Note</h4>
+
#top_menu_inside {
−
<p>Note that parts must be documented on the <a href="http://parts.igem.org/Main_Page"> Registry</a>. This page serves to <i>showcase</i> the parts you have made. Future teams and other users and are much more likely to find parts by looking in the Registry than by looking at your team wiki.</p>
+
margin-left: 0px;
−
</div>
+
}
 +
</style>
  
 +
    </head>
 +
    <body class="landing-page">
 +
        <nav class="navbar navbar-default navbar-fixed-top navbar-burger" role="navigation">
 +
            <!-- if you want to keep the navbar hidden you can add this class to the navbar "navbar-burger"-->
 +
            <div class="container">
 +
                <div class="navbar-header">
 +
                    <button id="menu-toggle" type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target="#example">
 +
                    <span class="sr-only">Toggle navigation</span>
 +
                    <span class="icon-bar bar1"></span>
 +
                    <span class="icon-bar bar2"></span>
 +
                    <span class="icon-bar bar3"></span>
 +
                    </button>
 +
<a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary" class="navbar-brand">W&M iGEM 2015</a>
 +
                </div>
 +
                <div class="collapse navbar-collapse">
 +
                    <ul class="nav navbar-nav navbar-right navbar-uppercase">
 +
<p>    </p>
  
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary">
 +
                            Home
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Description">
 +
                            Project Description
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary#parts">
 +
                            Parts
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Measurement">
 +
                            Measurement
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Interlab_Study">
 +
                            Interlab Study
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Collaborations">
 +
                            Collaboration
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Software">
 +
                          Software
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Practices">
 +
                            Human Practices
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="http://issuu.com/wmigem/docs/wmigemsynbiodraft150806">
 +
                            Curriculum on ISSUU.com
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary#ref">
 +
                            Notebook, Safety, & Attributions
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                        <li>
 +
                            <a href="https://2015.igem.org/Team:William_and_Mary/Medal_Criteria">
 +
                            Medal Criteria
 +
                            </a>
 +
                        </li>
 +
                    </ul>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </nav>
 +
       
 +
       
 +
       
 +
       
 +
       
 +
       
 +
       
 +
        <div class="wrapper">
 +
       
 +
       
 +
       
 +
            <!--    replace this line with the code generated with the rubik-builder.html              -->
  
−
<h4>Adding parts to the registry</h4>
+
                   
−
<p>You can add parts to the Registry at our <a href="http://parts.igem.org/Add_a_Part_to_the_Registry">Add a Part to the Registry</a> link.</p>
+
                        <!-- Section "Our Projects" example 2: 3 Columns Full Width -->
−
<p>We encourage teams to start completing documentation for their parts on the Registry as soon as you have it available. The sooner you put up your parts, the better you will remember all the details about your parts. Remember, you don't need to send us the DNA sample before you create an entry for a part on the Registry. (However, you <b>do</b> need to send us the DNA sample before the Jamboree. If you don't send us a DNA sample of a part, that part will not be eligible for awards and medal criteria.)</p>
+
                        <div class="section section-we-made-1 section-with-hover" id="projects1">
 +
                            <div class="text-area">
 +
                                <div class="title">
 +
                                    <p class="h2WM">All Parts (By Category)</p>
 +
<!--                                    <div class="separator-container">
 +
                                        <div class="separator line-separator">✻</div>
 +
                                    </div>-->
 +
                                    <p>In deciding which parts to submit to the iGEM Registry we focused on three main aspects.</p>
 +
<p>First: ensuring our project is as reproducible and extensible as possible. To that end we have submitted all of new composite fluorescent protein parts that we constructed during the project. Second: Making genome integration as straightforward as possible for iGEM teams. In order to accomplish this goal we designed, tested, and validated a new integrator cassette that allows for simple genome integration using either 3A or Gibson Assembly.  Third: Increasing the number of tools available for promoter-mediated regulation in synthetic biology. We created and validated an E. coli codon optimized dCas9 variant and a suite of gRNAs to target the most commonly used promoters in iGEM.  </p>
 +
</p>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                            <div class="row" id="projectsLine1">
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/b/bf/Wm15integration.jpg">
 +
                                        <a class="over-area color-green" href="javascript:void(0)" onclick="rubik.showModal(this)" data-target="integrator">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>Integrator Suites</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/cf/Wm15repression.jpg">
 +
                                        <a class="over-area color-black" href="javascript:void(0)" onclick="rubik.showModal(this)" data-target="antibiotic">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>Antibiotic Operons</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="dCas9 Plates" src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/36/WMdCas9Plates.png">                                   
 +
                                        <a class="over-area color-blue " href="javascript:void(0)" onclick="rubik.showModal(this)" data-target="dcas">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>dCas9s</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/d/dc/Wm15guide.jpg">
 +
                                        <a class="over-area color-purple" href="javascript:void(0)" onclick="rubik.showModal(this)" data-target="grna">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>gRNAs</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/4f/Wm15antibiotic.jpg">
 +
                                        <a class="over-area color-green" href="javascript:void(0)" onclick="rubik.showModal(this)" data-target="xfp">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>XFPs under various promoters</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="col-md-4">
 +
                                    <div class="project">
 +
                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3c/WMG2.png">
 +
                                        <a class="over-area color-gold" href="#" target="g2">
 +
                                            <div class="content">
 +
                                                <h4>G^2</h4>
 +
                                                <p>Click for details.</p>
 +
                                            </div>
 +
                                        </a>
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <!-- End Section "Our Projects" example 2: 3 Columns Full Width -->
 +
                     
 +
       
 +
       
 +
        <!--  Here are the examples of the content for each project that is viewed inside of the page. You can create how many projects you want if you set the specific #id     
 +
        -->
 +
       
 +
        <div class="project-content" id="integrator">
 +
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                  <p class "h2WM">Integrator Suites</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
  
 +
              <div class="project-content" id="antibiotic">
 +
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                    <p class "h2WM">Antibiotic Operons</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
  
−
<h4>What information do I need to start putting my parts on the Registry?</h4>
 
−
<p>The information needed to initially create a part on the Registry is:</p>
 
−
<ul>
 
−
<li>Part Name</li>
 
−
<li>Part type</li>
 
−
<li>Creator</li>
 
−
<li>Sequence</li>
 
−
<li>Short Description (60 characters on what the DNA does)</li>
 
−
<li>Long Description (Longer description of what the DNA does)</li>
 
−
<li>Design considerations</li>
 
−
</ul>
 
  
−
<p>
+
              <div class="project-content" id="dcas">
−
We encourage you to put up <em>much more</em> information as you gather it over the summer. If you have images, plots, characterization data and other information, please also put it up on the part page. </p>
+
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                    <p class "h2WM">dCas9s</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
  
  
 +
              <div class="project-content" id="grna">
 +
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                    <p class "h2WM">gRNAs</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
 +
       
  
 +
              <div class="project-content" id="xfp">
 +
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                    <p class "h2WM">XFPs Under Various Promoters</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
  
  
 +
              <div class="project-content" id="g2">
 +
          <div>
 +
            <div class="project-details">
 +
              <span class="icon-close"><i class="pe-7s-close-circle"></i></span>
 +
              <div class="container">
 +
                <div class="project-title">
 +
                    <p class "h2WM">G^2</p>
 +
                </div>
 +
                <div class="row">
 +
                  <div class="col-md-4">
 +
                    <div class="project-text">
 +
                      <p><span>Detail</span>1</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>2</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>3</p>
 +
                      <p><span>Detail</span>4</p>
 +
                      <br>
 +
                      <p>text</p>
 +
                      <p>text</p>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                  <div class="col-md-8">
 +
                    <div class="row">
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                          <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="col-md-6">
 +
                            <div class="project-image">
 +
                              <img alt="..." src="assets/img/rubik_background2.jpg"/>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                  </div>
 +
                </div>
 +
              </div>
 +
            </div>
 +
          </div>
 +
        </div>
  
−
<h4>Inspiration</h4>
+
        <div class="body-layer"></div>
−
<p>We have a created  a <a href="http://parts.igem.org/Well_Documented_Parts">collection of well documented parts</a> that can help you get started.</p>
+
    </body>
 +
   
 +
   
 +
   
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2015.igem.org/Template:William_and_Mary/jquery1112minJS?
 +
action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
   
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2015.igem.org/Template:William_and_Mary/bootstrapJS?
 +
action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
 
  
−
<p> You can also take a look at how other teams have documented their parts in their wiki:</p>
+
    <script type="text/javascript" src="https://2015.igem.org/Template:William_and_Mary/jquerywaypointsminJS?
−
<ul>
+
action=raw&ctype=text/javascript"></script>
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:MIT/Parts"> 2014 MIT </a></li>
+
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Heidelberg/Parts"> 2014 Heidelberg</a></li>
+
−
<li><a href="https://2014.igem.org/Team:Tokyo_Tech/Parts">2014 Tokyo Tech</a></li>
+
−
</ul>
+
  
 +
    <script type="text/javascript" src="http://presentation.paperplane.io/assets/js/modernizr.js"></script>
  
−
 
+
    <script type="text/javascript" src="https://2015.igem.org/Template:William_and_Mary/rubickJS?
−
<h4>Part Table </h4>
+
action=raw&ctype=text/javascript"></script>
−
</html>
+
−
<groupparts>iGEM015 Example</groupparts>
+
−
<html>
+
−
 
+
−
 
+
−
 
+
−
</div>
+
 
</html>
 
</html>

Revision as of 23:05, 17 September 2015

NOISE - W&M iGEM

All Parts (By Category)

In deciding which parts to submit to the iGEM Registry we focused on three main aspects.

First: ensuring our project is as reproducible and extensible as possible. To that end we have submitted all of new composite fluorescent protein parts that we constructed during the project. Second: Making genome integration as straightforward as possible for iGEM teams. In order to accomplish this goal we designed, tested, and validated a new integrator cassette that allows for simple genome integration using either 3A or Gibson Assembly. Third: Increasing the number of tools available for promoter-mediated regulation in synthetic biology. We created and validated an E. coli codon optimized dCas9 variant and a suite of gRNAs to target the most commonly used promoters in iGEM.

Integrator Suites

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...

Antibiotic Operons

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...

dCas9s

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...

gRNAs

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...

XFPs Under Various Promoters

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...

G^2

Detail1

Detail2

Detail3

Detail4


text

text

...
...
...
...