Difference between revisions of "Team:UESTC Software/Documentation.html"

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−
<!DOCTYPE html>
 
−
<html class="no-js">
 
−
<head>
 
−
<meta charset="UTF-8">
 
−
<meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1">
 
−
<title>Documentation- Requirements</title>
 
−
<style>
 
  
−
</style>
 
−
 
−
</head>
 
−
<body>
 
−
<link rel="stylesheet" href="https://2015.igem.org/Template:UESTC_Software/CSS?action=raw&ctype=text/css">
 
−
<link rel="stylesheet" href="https://2015.igem.org/Template:UESTC_Software/divide_dou_css?action=raw&ctype=text/css">//我的分页
 
−
<script src="https://2015.igem.org/Template:UESTC_Software/headjs?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
−
 
−
 
−
<header class="dou_header">
 
−
<div class="header_logo">
 
−
<a href="javascript:void(0)"><img src="/wiki/images/f/fc/Uestc_software_head_logo.png"></a>
 
−
</div>
 
−
<nav class="dou_divide_nav">
 
−
<div class="dou_divide_nav_wrap">
 
−
<ul>
 
−
<li>
 
−
<a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software">HOME</a>
 
−
</li>
 
−
<li>
 
−
<a class="" href="javascript:void(0)">PROJECT<br/><i class="iconfont">&#xe60d;</i></a>
 
−
<ul id="menu_pro" class="dou_divide_nav_second clearfix">
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Description.html">Description</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Results.html">Results</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Design.html">Design</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Modeling.html">Modeling</a></li>
 
−
</ul>
 
−
</li>
 
−
<li>
 
−
<a href="javascript:void(0)">TEAM<br/><i class="iconfont">&#xe60d;</i></a>
 
−
<ul id="menu_team" class="dou_divide_nav_second">
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Members.html">Members</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Attributions.html">Attributions</a></li>
 
−
</ul>
 
−
</li>
 
−
<li>
 
−
<a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Notebook.html">NOTEBOOK</a>
 
−
</li>
 
−
<li>
 
−
<a href="javascript:void(0)">HUMAN<br/>PRACTICE<br/><i class="iconfont">&#xe60d;</i></a>
 
−
<ul id="menu_hum" class="dou_divide_nav_second">
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Game-human_practice.html">Game</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Meet_up.html">Meet-up</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Collaborations.html">Collaborations</a></li>
 
−
</ul>
 
−
</li>
 
−
<li class="choose">
 
−
<a href="javascript:void(0)">REQUIREMENTS<br/><i class="iconfont">&#xe60d;</i></a>
 
−
<ul id="menu_req" class="dou_divide_nav_second">
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Medals.html">Medals</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Safety.html">Safety</a></li>
 
−
<li><a href="https://2015.igem.org/Team:UESTC_Software/Documentation.html">Documentation</a></li>
 
−
</ul>
 
−
</li>
 
−
</ul>
 
−
</div>
 
−
</nav>
 
−
</header>
 
−
<div class="wrap_content">
 
−
<div class="back_to_top">
 
−
<i class="iconfont">&#xe60a;</i>
 
−
</div>
 
−
<section class="cd_half_section" id="c_h_s_meet">
 
−
<h1>Documentation</h1>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_title dou_table_title">
 
−
<h2>Service API Documentation</h2>
 
−
                        <p><i>Developers can reuse the function of our software quickly by use Service API.</i></p>
 
−
</div>
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/api/cegRecord/fetchCeg.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the minimal gene set filtered.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/cegRecord/fetchCeg.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
<div class="dou_t_des">1 Get minimal gene set</div>
 
−
</div>
 
−
 
−
</div>
 
−
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/api/cegRecord/compare.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the minimal gene set. Statics is the statistical value.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/cegRecord/compare.php?id=01020304+05060708</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                    <div class="dou_t_des">2 Compare two minimal gene sett</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>api/download/cegCSV.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>File with CSV format.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/download/cegCSV.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">3 Download minimal gene set with CSV format</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>api/download/cegXML.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>File with XML format.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/download/cegXML.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">4 Download minimal gene set with XML format</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>api/kegg/entireModule.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the URL of module results.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/kegg/entireModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">5 Get module with whole minimal gene set</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>api/kegg/entirePathway.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the URL of pathway results.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/kegg/entireModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">6 Get pathway with whole minimal gene set</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>api/kegg/metabolicModule.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the URL of module results.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/kegg/metabolicModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">7 Get module with gene set that only about metabolism</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/api/kegg/metabolicPathway.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Result in json style. Status 0 means execute successfuly, and 1 means error. Data is the URL of pathway results.</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/api/kegg/metabolicPathway.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">8 Get pathway with gene set that only about metabolism</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<!--隔开！！！！-->
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_title dou_table_title">
 
−
<h2>Service Page Documentation</h2>
 
−
                        <p><i>Service Page can be visited directly to view the corresponding result.</i></p>
 
−
</div>
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/app/page/mapEntireModule.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Module list</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/app/page/mapEntireModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
<div class="dou_t_des">1 Page of Module wtih whole minimal gene set</div>
 
−
</div>
 
−
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/app/page/mapEntirePathway.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Pathway list</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/app/page/mapEntireModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">2 Page of pathway wtih whole minimal gene set</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/app/page/mapMetaModule.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Module list</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/app/page/mapMetaModule.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">3 Page of module with gene set that only about metabolism</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
<section class="cd-section">
 
−
<div class="cd-main-content">
 
−
<div class="dou_m_c_p">
 
−
<div class="dou_table">
 
−
<table>
 
−
<tr>
 
−
<td>URL</td>
 
−
<td>/app/page/mapMetaPathway.php</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>GET</td>
 
−
<td>id</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Return</td>
 
−
<td>Module list</td>
 
−
</tr>
 
−
<tr>
 
−
<td>Example</td>
 
−
<td>
 
−
<a href="">http://yourHost.com/app/page/mapMetaPathway.php?id=01020304</a>
 
−
</td>
 
−
</tr>
 
−
</table>
 
−
</div>
 
−
                                        <div class="dou_t_des">4 Page of pathway wtih gene set that only about metabolism</div>
 
−
</div>
 
−
</div>
 
−
</section>
 
−
</div>
 
−
<footer>
 
−
<div class="footer_define">
 
−
<div class="footer_logo">
 
−
<img src="/wiki/images/0/07/Uestc_software_self_logo.png">
 
−
<p>@2015 Designed & Developed by <span class="green_em">UESTC_SOFTWARE</span> iGEM</p>
 
−
</div>
 
−
<ul>
 
−
<li></li>
 
−
</ul>
 
−
</div>
 
−
</footer>
 
−
</body>
 

Latest revision as of 15:44, 17 September 2015