Difference between revisions of "Team:Aix-Marseille/Sequencing/data"

Line 139: Line 139:
 
     <h2 class="title wow Hinge"><span style="color:#8E3B8C">TITTLE</h2></span>
 
     <h2 class="title wow Hinge"><span style="color:#8E3B8C">TITTLE</h2></span>
 
     <div class="space30"></div>
 
     <div class="space30"></div>
     <p class="space20"><div align="justify">Alignment of Sequence_1:  [19-17-VF2.seq] with  Sequence_2: [pSB1C3-J23101-I13504.xdna]
+
     <p class="space20"><div align="justify">
 
+
Similarity : 1037/2988 (34,71 %)
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1    gtccggcaaaaaagggcaaggtgtcaccaccctgccctttttctttaaaaccgaaaagat  60
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  61    tacttcgcgttatgcaggcttcctcgctcactgactcgctgcgctcggtcgttcggctgc  120
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  121  ggcgagcggtatcagctcactcaaaggcggtaatacggttatccacagaatcaggggata  180
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  181  acgcaggaaagaacatgtgagcaaaaggccagcaaaaggccaggaaccgtaaaaaggccg  240
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  241  cgttgctggcgtttttccacaggctccgcccccctgacgagcatcacaaaaatcgacgct  300
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  301  caagtcagaggtggcgaaacccgacaggactataaagataccaggcgtttccccctggaa  360
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  361  gctccctcgtgcgctctcctgttccgaccctgccgcttaccggatacctgtccgcctttc  420
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  421  tcccttcgggaagcgtggcgctttctcatagctcacgctgtaggtatctcagttcggtgt  480
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  481  aggtcgttcgctccaagctgggctgtgtgcacgaaccccccgttcagcccgaccgctgcg  540
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  541  ccttatccggtaactatcgtcttgagtccaacccggtaagacacgacttatcgccactgg  600
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  601  cagcagccactggtaacaggattagcagagcgaggtatgtaggcggtgctacagagttct  660
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  661  tgaagtggtggcctaactacggctacactagaagaacagtatttggtatctgcgctctgc  720
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  721  tgaagccagttaccttcggaaaaagagttggtagctcttgatccggcaaacaaaccaccg  780
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  781  ctggtagcggtggtttttttgtttgcaagcagcagattacgcgcagaaaaaaaggatctc  840
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  841  aagaagatcctttgatcttttctacggggtctgacgctcagtggaacgaaaactcacgtt  900
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  901  aagggattttggtcatgagattatcaaaaaggatcttcacctagatccttttaaattaaa  960
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  961  aatgaagttttaaatcaatctaaagtatatatgagtaaacttggtctgacagctcgaggc  1020
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1021  ttggattctcaccaataaaaaacgcccggcggcaaccgagcgttctgaacaaatccagat  1080
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1081  ggagttctgaggtcattactggatctatcaacaggagtccaagcgagctcgatatcaaat  1140
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1141  tacgccccgccctgccactcatcgcagtactgttgtaattcattaagcattctgccgaca  1200
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1201  tggaagccatcacaaacggcatgatgaacctgaatcgccagcggcatcagcaccttgtcg  1260
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1261  ccttgcgtataatatttgcccatggtgaaaacgggggcgaagaagttgtccatattggcc  1320
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1321  acgtttaaatcaaaactggtgaaactcacccagggattggctgagacgaaaaacatattc  1380
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1381  tcaataaaccctttagggaaataggccaggttttcaccgtaacacgccacatcttgcgaa  1440
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1441  tatatgtgtagaaactgccggaaatcgtcgtggtattcactccagagcgatgaaaacgtt  1500
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1501  tcagtttgctcatggaaaacggtgtaacaagggtgaacactatcccatatcaccagctca  1560
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1561  ccgtctttcattgccatacgaaattccggatgagcattcatcaggcgggcaagaatgtga  1620
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1621  ataaaggccggataaaacttgtgcttatttttctttacggtctttaaaaaggccgtaata  1680
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1681  tccagctgaacggtctggttataggtacattgagcaactgactgaaatgcctcaaaatgt  1740
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ------------------------------------------------------------  0
+
                                                                       
+
Seq_2  1741  tctttacgatgccattgggatatatcaacggtggtatatccagtgatttttttctccatt  1800
+
 
+
 
+
Seq_1  1    ---------------------------gattacTatAAaan-------------------  14
+
                                        ||| |||  ||||:                 
+
Seq_2  1801  ttagcttccttagctcctgaaaatctcgataactcaaaaaatacgcccggtagtgatctt  1860
+
 
+
 
+
Seq_1  15    ------------------------------------------------------------  14
+
                                                                       
+
Seq_2  1861  atttcattatggtgaaagttggaacctcttacgtgcccgatcaactcgagtgccacctga  1920
+
 
+
 
+
Seq_1  15    ------------------------------------------TaGGCGTaTcAcGaggCA  32
+
                                                      ||||||||||||||||||
+
Seq_2  1921  cgtctaagaaaccattattatcatgacattaacctataaaaataggcgtatcacgaggca  1980
+
 
+
 
+
Seq_1  33    GAATTTCAGATAAAAAAAaTCCTTAGCTTTCGCTAAGGATGATTTCTGGAATTCGCGGCC  92
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  1981  gaatttcagataaaaaaaatccttagctttcgctaaggatgatttctggaattCGCGGCC  2040
+
 
+
 
+
Seq_1  93    GCTTCTAGAGTTTACAGCTAGCTCAGTCCTAGGTATTATGCTAGCTACTAGAGAAAGAGG  152
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2041  GCTTCTAGAGtttacagctagctcagtcctaggtattatgctagcTActagAGaaagagg  2100
+
 
+
 
+
Seq_1  153  AGAAATACTAGATGCGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTG  212
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2101  agaaatactagatgcgtaaaggagaagaacttttcactggagttgtcccaattcttgttg  2160
+
 
+
 
+
Seq_1  213  AATTAGATGGTGATGTTAATGGGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATG  272
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2161  aattagatggtgatgttaatgggcacaaattttctgtcagtggagagggtgaaggtgatg  2220
+
 
+
 
+
Seq_1  273  CAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTATTTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCAT  332
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2221  caacatacggaaaacttacccttaaatttatttgcactactggaaaactacctgttccat  2280
+
 
+
 
+
Seq_1  333  GGCCAACACTTGTCACTACTTTCGGTTATGGTGTTCAATGCTTTGCGAGATACCCAGATC  392
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2281  ggccaacacttgtcactactttcggttatggtgttcaatgctttgcgagatacccagatc  2340
+
 
+
 
+
Seq_1  393  ATATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCCGAAGGTTATGTACAGGAAAGAA  452
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2341  atatgaaacagcatgactttttcaagagtgccatgcccgaaggttatgtacaggaaagaa  2400
+
 
+
 
+
Seq_1  453  CTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTG  512
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2401  ctatatttttcaaagatgacgggaactacaagacacgtgctgaagtcaagtttgaaggtg  2460
+
 
+
 
+
Seq_1  513  ATACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTC  572
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2461  atacccttgttaatagaatcgagttaaaaggtattgattttaaagaagatggaaacattc  2520
+
 
+
 
+
Seq_1  573  TTGGACACAAATTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAAC  632
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2521  ttggacacaaattggaatacaactataactcacacaatgtatacatcatggcagacaaac  2580
+
 
+
 
+
Seq_1  633  AAAAGAATGGAATCAAAGTTAACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTC  692
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2581  aaaagaatggaatcaaagttaacttcaaaattagacacaacattgaagatggaagcgttc  2640
+
 
+
 
+
Seq_1  693  AACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCCAATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAG  752
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2641  aactagcagaccattatcaacaaaatactccaattggcgatggccctgtccttttaccag  2700
+
 
+
 
+
Seq_1  753  ACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGATCCCAACGAAAnGAGAGACC  812
+
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
+
Seq_2  2701  acaaccattacctgtccacacaatctgccctttcgaaagatcccaacgaaaagagagacc  2760
+
 
+
 
+
Seq_1  813  ACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGGATGAACTAT  872
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2761  acatggtccttcttgagtttgtaacagctgctgggattacacatggcatggatgaactat  2820
+
 
+
 
+
Seq_1  873  ACAAATAATAATACTAGAGCCAGGCATCAAnTAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGG  932
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2821  acaaataataatactagagccaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgg  2880
+
 
+
 
+
Seq_1  933  GCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCtACTAGaGTCACACTGGCTCA  992
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
+
Seq_2  2881  gcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctctactagagtcacactggctca  2940
+
 
+
 
+
Seq_1  993  CCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTTATATACTAGTAGCGGCCGCTGCAGTCCGGCAaAAn  1052
+
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
+
Seq_2  2941  ccttcgggtgggcctttctgcgtttataTACTAGTAGCGGCCGCtgca------------  2988
+
 
+
 
+
Seq_1  1053  nGGgCAAGgtgTCACCaCCcTGCCcTTTTtCTTtAAaaCCGAAangaTTACTTCGCgttA  1112
+
                                                                       
+
Seq_2  2989  ------------------------------------------------------------  2988
+
 
+
 
+
Seq_1  1113  TGCAGgCTTCCtcgcTCAcTGACTCGCTGCGCtCGgTCGTTCGGCTGcGgCGaacGGtaT  1172
+
                                                                       
+
Seq_2  2989  ------------------------------------------------------------  2988
+
 
+
 
+
Seq_1  1173  CAGctc  1178
+
                 
+
Seq_2  2989  ------  2988
+
 
+
 
+
 
+
 
+
 
+
 
+
Features [Seq_2]:
+
SpeI    : [2970 : 2975 - CW]
+
EcoRI    : [2029 : 2034 - CW]
+
XbaI    : [2044 : 2049 - CW]
+
PstI    : [2984 : 1 - CW]
+
Suffix  : [1 : 1 - CW]
+
Suffix  : [2969 : 2988 - CW]
+
Suffix  : [2969 : 1 - CW]
+
</div></p>
+
  
  

Revision as of 07:09, 18 September 2015

Chew fight

TITTLE

TITTLE

TEXTE

TEXTE

TEXTE

TEXTE

TEXTE

MORE INFORMATION ON FACEBOOK !

SPONSORS

Useful Links

Contact Us


  • Aix Marseille Université
  • Marseille
  • France

Chew figth project, for the iGEM competition. See you soon in Boston !