Difference between revisions of "Team:TrinityCollegeDublin"

 
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<html>
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<head>
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    <link href=
 +
    "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/stylesheet?action=raw&ctype=text/css"
 +
    rel="stylesheet" type="text/css">
  
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    <title></title>
 +
</head>
  
−
<html>
+
<body>
 +
    <div class="logo logoAnimation"><a href="https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin"><img src=
 +
    "https://static.igem.org/mediawiki/2015/8/8b/TrinityDublin15_LogoGIF.gif" width="147"></a></div>
  
−
<style>
+
    <form>
 +
        <input class="navBarCheckbox" id="navBarCheckbox" type="checkbox">
 +
    </form>
  
 +
    <nav class="menu fadeIn">
 +
        <ul>
 +
            <li>
 +
                <a><img height="50px" src=
 +
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/f6/TrinityDublin15_IconProject.png"
 +
                width="50px"></a>
  
−
body {
+
                <ul>
−
    margin: 0;
+
                    <li>
−
    padding: 0;
+
                        <a href=
−
}
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Background">
 +
                        Background</a>
 +
                    </li>
  
−
/*-------------------------NavBar-------------------------*/
+
                    <li>
 +
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Design">
 +
                        E.artemisia Design</a>
 +
                    </li>
  
−
nav{
+
                    <li>
−
z-index: 100;
+
                        <a href=
−
background-color: rgba(255,255,255,0.7);
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Results">
−
padding: 0.2em; /*NavBarHeight*/
+
                        Results</a>
−
min-height: 2em;
+
                    </li>
−
line-height: 1em;
+
−
max-height: 90px;
+
−
     
+
−
}
+
  
−
nav ul {
+
                    <li>
−
  margin-left: 7.5em;
+
                        <a href=
−
  padding-right: 5em;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Conclusions">
−
  text-align: right;
+
                        Conclusions</a>
−
  transition: max-height 0.25s linear;
+
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
 +
 
 +
            <li>
 +
                <a><img height="50px" src=
 +
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/22/TrinityDublin15_IconInterlab.png"
 +
                width="50px"></a>
 
        
 
        
−
}
+
                <ul>
 +
                    <li>
 +
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Measurement">
 +
                        Interlab</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
  
−
.menu ul > li {
+
            <li>
−
  transition: visibility .5s linear;
+
                <a><img height="50px" src=
−
  display: inline-block;
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/2a/TrinityDublin15_IconParts.png"
−
  text-align: left;
+
                width="50px"></a>
−
  padding: 0.8em 0em;
+
     
−
  margin: 0 .5em;
+
                <ul>
−
  position: relative;
+
                    <li>
−
 
+
                        <a href=
−
}
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Part_Collection">
−
 
+
                        Parts</a>
−
nav li:hover {
+
                    </li>
−
    background-color: #000000;
+
                </ul>
−
}
+
            </li>
  
−
/* Hide Dropdowns by Default and giving it a position of absolute */
+
            <li>
−
nav ul ul {
+
                <a><img height="50px" src=
−
    display: none;
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3b/TrinityDublin15_IconNotebook.png"
−
    position: absolute;
+
                width="50px"></a>
−
    margin-left: 0;
+
−
    padding-left: 0;
+
−
    margin-top: 14 !important;
+
−
     
+
−
}
+
  
−
nav a, u {
+
                <ul>
−
    text-decoration: none;
+
                    <li>
−
    color: black;}
+
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Timeline">
 +
                        Timeline</a>
 +
                    </li>
  
 +
                    <li>
 +
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Protocols">
 +
                        Protocols</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
  
−
/* Display Dropdowns on Hover */
+
            <li>
−
.menu li:hover > ul {
+
                <a><img height="50px" src=
−
    display: block;
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/6/68/TrinityDublin15_IconHumanPractices.png"
−
 
+
                width="50px"></a>
−
}
+
−
+
−
/* Fisrt Tier Dropdown */
+
−
nav ul ul li {
+
−
    min-width:170px;
+
−
    float:none;
+
−
    position: relative;
+
−
+
−
}
+
  
−
.menu > ul > li > ul > li{
+
                <ul>
−
  background-color: rgba(255,255,255,0.7);
+
                    <li>
−
}
+
                        <a href=
−
/*-------------------------Media Rules-------------------------*/
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Practices">
−
@media (max-width: 970px) {
+
                        Global Health</a>
−
        .menu > ul > li{
+
                    </li>
−
            padding-left: 1px;
+
−
        padding-right: 1px;}
+
−
}
+
−
+
−
@media (max-width: 890px) {
+
−
        .menu > ul {
+
−
        padding-right: 0;}
+
−
}
+
  
−
@media (max-width: 800px) {
+
                    <li>
−
        .menu > ul > li{
+
                        <a href=
−
        padding-left: 0;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Malaria">
−
        padding-right: 0;
+
                        Malaria</a>
−
        margin-left: 0;
+
                    </li>
−
        margin-right: 0;}
+
−
+
−
        .logo > img {
+
−
        width: 120px;}
+
−
            .menu > ul {
+
−
        padding-left: 5;}
+
−
}
+
  
−
@media (max-width: 640px) {
+
                    <li>
−
        .logo > img {
+
                        <a href=
−
        width: 85px;}
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/GenderInequality">
−
       
+
                        Gender Inequality</a>
−
        .menu > ul {
+
                    </li>
−
        margin-left: 65;}
+
−
}
+
  
−
@media (min-width: 585px) {
+
                    <li>
−
   
+
                        <a href=
−
    .menu li ul {
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Children">
−
    position: absolute;
+
                        Children</a>
−
    margin-top: 1px;
+
                    </li>
−
    left: -1px;
+
−
    right: -1px;
+
−
  }
+
−
   
+
−
  .menu li li {
+
−
    margin: -1px 0 0 0;
+
−
    box-sizing: border-box;
+
−
    width: 100%;
+
−
  }
+
−
   
+
−
   
+
−
}
+
−
@media (max-width: 584px) {
+
−
    .menu{
+
−
        max-height: 50;
+
−
    }
+
−
   
+
−
    .menu > ul > li {
+
−
    visibility: hidden;
+
−
    display: inline-block;
+
−
    padding: 0.1em 0.1em;
+
−
    border: none;
+
−
}
+
−
    .logo > img {
+
−
        width: 65px;
+
−
} 
+
−
    .artemisininGIF img {
+
−
    margin-top: -60px;
+
−
}     
+
−
    .menu > ul {
+
−
    max-height: 0;
+
−
    margin: 5.7em 3em 1em 3em;
+
−
    background-color: rgba(255,255,255,0.85);
+
−
}
+
−
    .menu .navBarDropdown {
+
−
    display: block;
+
−
}
+
−
    #navBarCheckbox:checked + .menu > ul {
+
−
    max-height: 500px;
+
−
}
+
−
    #navBarCheckbox:checked + .menu > ul > li {
+
−
    visibility: visible;
+
−
}
+
−
}
+
  
−
/*-------------------------Dropdown-------------------------*/
+
                    <li>
−
.navBarCheckbox {
+
                        <a href=
−
  display: none;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Logistics">
−
}
+
                        Logistics</a>
−
.navBarDropdown {
+
                    </li>
−
  display: none;
+
−
  cursor: pointer;
+
−
  position: relative;
+
−
  font-size: 45px;
+
−
  padding: .5em 0;
+
−
  height: 0;
+
−
  width: 1.66666667em;
+
−
  border-top: 0.13333333em solid;
+
−
}
+
−
.navBarDropdown:before,
+
−
.navBarDropdown:after {
+
−
  position: absolute;
+
−
  left: 0;
+
−
  right: 0;
+
−
  content: ' ';
+
−
  border-top: 0.13333333em solid;
+
−
}
+
−
.navBarDropdown:before {
+
−
  top: 0.37777778em;
+
−
}
+
−
.navBarDropdown:after {
+
−
  top: 0.88888889em;
+
−
}
+
−
.menu {
+
−
  position: fixed;
+
−
  top: 0;
+
−
  left: 0;
+
−
  right: 0;
+
−
}
+
−
.menu .navBarDropdown {
+
−
  position: absolute;
+
−
  font-size: 1.2em;
+
−
  top: 0.7em;
+
−
  right: 12px;
+
−
  z-index: 10;
+
−
}
+
−
/*-------------------------Animations-------------------------*/
+
−
.logo {
+
−
    position: fixed;
+
−
    left: 8px;
+
−
    top: 8px;
+
−
    z-index: 111;
+
  
−
}
+
                    <li>
 +
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Future">
 +
                        Future</a>
 +
                    </li>
  
−
@-moz-keyframes logoAnimation {
+
                    <li>
−
    0% {left: 44%;
+
                        <a href=
−
        top: 42%;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Interviews">
−
        transform: scale(6.5);}
+
                        Interviews</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
  
−
    80%{left: 44%;
+
            <li>
−
        top: 42%;
+
                <a><img height="50px" src=
−
        transform: scale(6);}
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/e/e5/TrinityDublin15_IconPeople.png"
−
   
+
                width="50px"></a>
−
    100%{left: 8px;
+
−
        top: 8px;}
+
−
}
+
  
−
@keyframes logoAnimation {
+
                <ul>
−
    0% {left: 44%;
+
                    <li>
−
        top: 42%;
+
                        <a href=
−
        transform: scale(5.5);}
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Team">Team</a>
 +
                    </li>
  
−
    80%{left: 44%;
+
                    <li>
−
        top: 42%;
+
                        <a href=
−
        transform: scale(5);}
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Attributions">
−
   
+
                        Attributions</a>
−
    100%{left: 8px;
+
                    </li>
−
        top: 8px;}
+
−
}
+
  
−
.logoAnimation {
+
                    <li>
−
-webkit-animation:logoAnimation ease-in 1;  /* call our keyframe named fadeIn, use animattion ease-in and repeat it only 1 time */
+
                        <a href=
−
-moz-animation:logoAnimation ease-in 1;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Outreach">
−
animation:logoAnimation ease-in 1;
+
                        Outreach</a>
 +
                    </li>
  
−
-webkit-animation-fill-mode:forwards;  /* this makes sure that after animation is done we remain at the last keyframe value (opacity: 1)*/
+
                    <li>
−
-moz-animation-fill-mode:forwards;
+
                        <a href=
−
animation-fill-mode:forwards;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Sponsors">
 +
                        Sponsors</a>
 +
                    </li>
  
−
-webkit-animation-duration:2s;
+
                    <li>
−
-moz-animation-duration:2s;
+
                        <a href=
−
animation-duration:2s;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Gallery">
−
   
+
                        Gallery</a>
−
    -webkit-animation-delay: 0s;
+
                    </li>
−
    -moz-animation-delay: 0s;
+
                </ul>
−
    animation-delay: 0s;
+
            </li>
−
   
+
−
    -webkit-transition: width 2s, height 4s; /* Safari */
+
−
    transition: width 2s, height 4s;
+
−
}
+
  
−
/*-------------------------NavBar-------------------------*/
+
            <li>
 +
                <a><img height="50px"
 +
                src=
 +
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/d/d0/TrinityDublin15_IconSafety.png"
 +
                width="50px"></a>
 +
     
 +
                <ul>
 +
                    <li>
 +
                        <a href=
 +
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Safety">
 +
                        Safety</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
  
−
/*-------------------------FadeIn-------------------------*/
+
            <li>
−
@-moz-keyframes fadeIn { from { opacity:0; } to { opacity:1;  } }
+
                <a><img height="50px" src=
−
@keyframes fadeIn { from { opacity:0; } to { opacity:1;  } }
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/7/77/TrinityDublin15_IconAchievement.png"
 +
                width="50px"></a>
  
−
.fadeIn {
+
                <ul>
−
opacity:0;  /* make things invisible upon start */
+
                    <li>
−
-webkit-animation:fadeIn ease-in 1;  /* call our keyframe named fadeIn, use animattion ease-in and repeat it only 1 time */
+
                        <a href=
−
-moz-animation:fadeIn ease-in 1;
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Achievements">
−
animation:fadeIn ease-in 1;
+
                        Achievements</a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </li>
  
−
-webkit-animation-fill-mode:forwards;  /* this makes sure that after animation is done we remain at the last keyframe value (opacity: 1)*/
+
            <li>
−
-moz-animation-fill-mode:forwards;
+
                <a href="#"><img height="50px" src=
−
animation-fill-mode:forwards;
+
                "https://static.igem.org/mediawiki/2015/9/9c/TrinityDublin15_IconCollaboration.png"
 +
                width="50px"></a>
  
−
-webkit-animation-duration:2s;
+
                <ul>
−
-moz-animation-duration:2s;
+
                    <li>
−
animation-duration:2s;
+
                        <a href=
−
   
+
                        "https://2015.igem.org/Team:TrinityCollegeDublin/Collaborations">
−
    -webkit-animation-delay: 1.5s;
+
                        iGEM Academy</a>
−
    -moz-animation-delay: 1.5s;
+
                    </li>
−
    animation-delay: 1.5s;
+
−
}
+
−
/*-------------------------FadeIn-------------------------*/
+
  
−
.standardMargin {
+
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        <h2>Combating Malaria with Synthetic Biology</h2>
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        One of the deadliest diseases in human history, <b>malaria now claims over 600,000 lives a year</b>.
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Our mission is to investigate the <b>production of affordable antimalarial drugs</b> by the means of synthetic biology. We are working with <b>artemisinic acid producing E.coli cells</b> obtained from Amyris, with the support of Zagaya.  
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We have constructed biobricks to take advantage of an <b>alternative pathway in artemesinin synthesis</b>. This pathway allows for the production of <b>dihydroartemisinic acid</b>, a direct precursor to artemisinin.
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This method has the potential for larger and cheaper artemisinin production in the future.
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            <!-- First Tier Drop Down -->
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                    <li><a href="#">Very long and tedious history</a></li>
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Latest revision as of 15:11, 26 October 2015

E.artemisia

Combating Malaria with Synthetic Biology




One of the deadliest diseases in human history, malaria now claims over 600,000 lives a year.

Our mission is to investigate the production of affordable antimalarial drugs by the means of synthetic biology. We are working with artemisinic acid producing E.coli cells obtained from Amyris, with the support of Zagaya.


We have constructed biobricks to take advantage of an alternative pathway in artemesinin synthesis. This pathway allows for the production of dihydroartemisinic acid, a direct precursor to artemisinin.

This method has the potential for larger and cheaper artemisinin production in the future.