Difference between revisions of "Team:London Biohackspace/lab-book"

Line 38: Line 38:
 
                   <h2>Protocols</h2>
 
                   <h2>Protocols</h2>
 
                       <h3><a href="#">Preparing liquid YEPD media</a></h3>
 
                       <h3><a href="#">Preparing liquid YEPD media</a></h3>
                       <p>1. For 1 litre of YEPD media measure the following into an eppendorf flask<br/><br/>
+
                       <p>1. For 1 litre of YEPD media measure the following into an erlenmayer flask<br/><br/>
 
                       Bacto yeast extract (Difco 0127-17) (1%) 10g<br/>
 
                       Bacto yeast extract (Difco 0127-17) (1%) 10g<br/>
 
                       Bacto peptone (Difco 0118-17) (2%) 20g<br/>
 
                       Bacto peptone (Difco 0118-17) (2%) 20g<br/>
 
                       Glucose (2%) 20g<br/><br/>
 
                       Glucose (2%) 20g<br/><br/>
 
                       Available premixed as Difco 0428-17.<br/><br/>
 
                       Available premixed as Difco 0428-17.<br/><br/>
                       2.  Autoclave for at least 15 minutes<br/>
+
                       2.  Autoclave for at least 15 minutes at 121C<br/>
 
                       </p>
 
                       </p>
 
                       <h3><a href="#">Preparing YEPD agar plates</a></h3>
 
                       <h3><a href="#">Preparing YEPD agar plates</a></h3>
                       <p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.</p>
+
                       <p>1. For 1 litre of YEPD media measure the following into an erlenmayer flask<br/><br/>
 +
                      Bacto yeast extract (Difco 0127-17) (1%) 10g<br/>
 +
                      Bacto peptone (Difco 0118-17) (2%) 20g<br/>
 +
                      Glucose (2%) 20g<br/><br/>
 +
                      Available premixed as Difco 0428-17.<br/><br/>
 +
                      Bacto agar (Difco 0140-01) (2%) 20g<br/><br/>
 +
                      2. Autoclave for at least 15 minutes at 121C<br/>
 +
                      2. Pour 20ml into an agar plate.  Leave to cool at room temperature for 2-3 hours and store at -4C<br/>
 +
                      </p>
 
                       <h3><a href="#">Transformation of <i>E. coli</i></a></h3>
 
                       <h3><a href="#">Transformation of <i>E. coli</i></a></h3>
 
                       <p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.</p>
 
                       <p>Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.</p>

Revision as of 14:00, 6 September 2015

Protocols

Preparing liquid YEPD media

1. For 1 litre of YEPD media measure the following into an erlenmayer flask

Bacto yeast extract (Difco 0127-17) (1%) 10g
Bacto peptone (Difco 0118-17) (2%) 20g
Glucose (2%) 20g

Available premixed as Difco 0428-17.

2. Autoclave for at least 15 minutes at 121C

Preparing YEPD agar plates

1. For 1 litre of YEPD media measure the following into an erlenmayer flask

Bacto yeast extract (Difco 0127-17) (1%) 10g
Bacto peptone (Difco 0118-17) (2%) 20g
Glucose (2%) 20g

Available premixed as Difco 0428-17.

Bacto agar (Difco 0140-01) (2%) 20g

2. Autoclave for at least 15 minutes at 121C
2. Pour 20ml into an agar plate. Leave to cool at room temperature for 2-3 hours and store at -4C

Transformation of E. coli

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Transformation of S. cerevisiae

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Experiments

Expressing Miraculin in S. cerevisiae

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Expressing Lycopene in S. cerevisiae

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Creating Leucine and Uracil auxotrophic S. cerevisiae strains

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

RNAi based regulation of mRFP in E. coli

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Results

Expressing Miraculin in S. cerevisiae

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Expressing Lycopene in S. cerevisiae

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Creating Leucine and Uracil auxotrophic S. cerevisiae strains

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

RNAi based regulation of mRFP in E. coli

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.