Difference between revisions of "Team:Lethbridge HS/Results"

 
(28 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 184: Line 184:
  
 
<body class="body_human_practices">
 
<body class="body_human_practices">
−
        <nav class="navbar navbar-inverse navbar-fixed-top menu" id="">
+
<nav class="navbar navbar-inverse navbar-fixed-top menu" id="">
 
             <div class="container-fluid">
 
             <div class="container-fluid">
 
                
 
                
 
                 <!--Lethbridge HS iGEM Logo -->
 
                 <!--Lethbridge HS iGEM Logo -->
 
                 <div class="navbar-header">
 
                 <div class="navbar-header">
−
                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Introduction" id="nav-head" class="navbar-brand" style="margin-top:10px;"><h1 id="headerText" style="font-weight:100; font-family: 'Mohave'; ">Lethbridge iGEM      </h1></a>
+
                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Introduction" id="nav-head" class="navbar-brand" style="margin-top:10px;"><h1 id="headerText" style="font-weight:100; font-family: 'existence'; ">Lethbridge iGEM      </h1></a>
 
                  
 
                  
  
Line 207: Line 207:
 
                             <ul class="dropdown-menu">
 
                             <ul class="dropdown-menu">
 
                                 <li>
 
                                 <li>
−
                                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Description">Description</a>
+
                                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Description">Background</a>
−
                                    <a href="#">Parts</a>
+
<a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Experiments">Experiments</a>
−
<a href="#">Achievements</a>
+
<a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Results">Results</a>
−
<a href="#">Results</a>
+
                                    <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Parts">Parts</a>
 +
<a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Achievements">Achievements</a>
 +
 
 
                                 </li>
 
                                 </li>
 
                             </ul>     
 
                             </ul>     
Line 217: Line 219:
 
                         <li margin-top:2%; style="margin-top:2%;"><a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Notebook">Notebook</a></li>
 
                         <li margin-top:2%; style="margin-top:2%;"><a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Notebook">Notebook</a></li>
 
                         <li margin-top:2%; style="margin-top:2%;"><a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Safety">Safety</a></li>
 
                         <li margin-top:2%; style="margin-top:2%;"><a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Safety">Safety</a></li>
−
<li class="texItem"  style="margin-top:2%;"><a class="" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Software">Software</a></li>
 
 
  <li class= "dropdown texItem" style="margin-top:2%;">
 
  <li class= "dropdown texItem" style="margin-top:2%;">
 
                             <a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team" class="dropdown-toggle" data-toggle = "dropdown">Team<b class="caret"></b></a>
 
                             <a class="textItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team" class="dropdown-toggle" data-toggle = "dropdown">Team<b class="caret"></b></a>
Line 223: Line 224:
 
                                 <li>
 
                                 <li>
 
                                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team">Students</a>
 
                                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team">Students</a>
−
                                     <a href="#">Advisors</a>
+
                                     <a href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team#section2">Advisors</a>
−
<a class="texItem" href="#">Sponsors</a>
+
<a class="texItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Team#section3">Sponsors</a>
−
<a class="texItem" href="#">Attributions</a>
+
<a class="texItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Attributions">Attributions</a>
−
<a class="texItem" href="#">Collaborations</a>
+
<a class="texItem" href="https://2015.igem.org/Team:Lethbridge_HS/Collaborations">Collaborations</a>
 
                                 </li>
 
                                 </li>
 
                             </ul>     
 
                             </ul>     
 
                         </li>
 
                         </li>
−
                       <li class=""><a class="picItem" href="team.html"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/21/LethHS2015_igemlogo.png" width="50px" height="45px" style="margin-top:-9%; margin-bottom:-10%;"></a></li>
+
                       <li class=""><a class="picItem" href="https://2015.igem.org/Main_Page"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/21/LethHS2015_igemlogo.png" width="50px" height="45px" style="margin-top:-9%; margin-bottom:-10%;"></a></li>
 
  <li class=""><div  onclick="myFunction()" id="nswitchIcon" class="navBarSwitchButton picItem"><img id="projectSwitchIcon" src="images/plainicon.com-48232-512px-7b5.png" class="img-responsive"></div> </li>
 
  <li class=""><div  onclick="myFunction()" id="nswitchIcon" class="navBarSwitchButton picItem"><img id="projectSwitchIcon" src="images/plainicon.com-48232-512px-7b5.png" class="img-responsive"></div> </li>
 
                     </ul>
 
                     </ul>
Line 243: Line 244:
 
                 </div>
 
                 </div>
 
          
 
          
−
                 <div class="container-fluid" id="regularPageBody">
+
                 <div class="container-fluid" id="regularPageBody" style="padding-left:10%; padding-right:10%;">
 
                     <div class="row">
 
                     <div class="row">
−
                        <div class="col-md-3" id="mainBodySideBar">
+
                      <div class="col-md-3" id="mainBodySideBar" style="display:none;">
 
                             <div class="sideBarContent">
 
                             <div class="sideBarContent">
 
                                 <ul>
 
                                 <ul>
Line 255: Line 256:
 
                             </div>
 
                             </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
−
                         <div class="col-md-9 col-sm-12">
+
                         <div class="col-md-12 col-sm-12">
 
                             <section id="section1">
 
                             <section id="section1">
 +
</section>
 
<h1 id="projecttext1" class="contentSubTitle"> Results <br><small></small></h1>
 
<h1 id="projecttext1" class="contentSubTitle"> Results <br><small></small></h1>
  
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Oxalic acid results:</b><br></p>
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Oxalic acid results:</b><br></p>
  
−
<div style="width:60%;">
+
<div style="width:60%;" class="bees">
−
<table class="table table-striped table-bordered"> <caption></caption>
+
<table class="table table-striped table-bordered">  
 
                                             <thead>
 
                                             <thead>
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
 
                                                     <th>Oxalic Acid Concentration (mg/mL)</th>
 
                                                     <th>Oxalic Acid Concentration (mg/mL)</th>
−
                                                     <th>OD<small>528</small></th>
+
                                                     <th>OD528</th>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
 
                                             </thead>
 
                                             </thead>
 
                                             <tbody>
 
                                             <tbody>
−
                                                <tr>
 
−
                                                    <td>0</td>
 
−
                                                    <td>1.7104</td>
 
−
                                                </tr>
 
−
                                                <tr>
 
−
                                                    <td>0.01</td>
 
−
                                                    <td>1.817 (only one trial)</td>
 
−
                                                </tr>
 
−
                                                <tr>
 
−
                                                    <td>0.5</td>
 
−
                                                    <td>1.647 (only one trial)</td>
 
−
                                                </tr>
 
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
 
                                                     <td>0.1</td>
 
                                                     <td>0.1</td>
−
                                                    <td>1.145125</td>
+
                                                    <td>1.862</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
−
                                                     <td>0.15</td>
+
                                                     <td>0.2</td>
−
                                                    <td>1.6255 (only two trials)</td>
+
                                                    <td>1.675</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.2</td>
 
−
                                                    <td>0.7021428571</td>
 
−
                                                </tr>
 
−
<tr>
 
−
                                                    <td>0.25</td>
 
−
                                                    <td>1.5195 (only two trials)</td>
 
−
                                                </tr>
 
−
<tr>
 
 
                                                     <td>0.3</td>
 
                                                     <td>0.3</td>
−
                                                     <td>0.588375</td>
+
                                                     <td>1.675</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.35</td>
+
−
                                                    <td>1.696 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.4</td>
 
                                                     <td>0.4</td>
−
                                                     <td>0.7051</td>
+
                                                     <td>1.655</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.45</td>
+
−
                                                    <td>1.737 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.5</td>
 
                                                     <td>0.5</td>
−
                                                     <td>0.6271428571</td>
+
                                                     <td>1.673</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.55</td>
+
−
                                                    <td>1.666 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.6</td>
 
                                                     <td>0.6</td>
−
                                                     <td>0.6502222222</td>
+
                                                     <td>1.680</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.65</td>
+
−
                                                    <td>1.674 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.7</td>
 
                                                     <td>0.7</td>
−
                                                     <td>0.6052857143</td>
+
                                                     <td>1.655</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.75</td>
+
−
                                                    <td>1.597 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.8</td>
 
                                                     <td>0.8</td>
−
                                                     <td>0.7459</td>
+
                                                     <td>1.630</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                 <tr>
−
                                                    <td>0.85</td>
+
−
                                                    <td>1.533 (only one trial)</td>
+
−
                                                 </tr>
+
−
<tr>
+
 
                                                     <td>0.9</td>
 
                                                     <td>0.9</td>
−
                                                     <td>0.504</td>
+
                                                     <td>1.587</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
                                                <tr>
 
                                                     <td>1.0</td>
 
                                                     <td>1.0</td>
−
                                                     <td>0.6849</td>
+
                                                     <td>1.564</td>
 
                                                 </tr>
 
                                                 </tr>
−
<tr>
+
 
−
                                                    <td>1.4</td>
+
−
                                                    <td>0.789 (only two trials)</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
<tr>
+
−
                                                    <td>1.5</td>
+
−
                                                    <td>0.983 (only one trial)</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
<tr>
+
−
                                                    <td>1.6</td>
+
−
                                                    <td>0.8195 (only two trial)</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
<tr>
+
−
                                                    <td>1.8</td>
+
−
                                                    <td>0.047 (only one trials)</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
<tr>
+
−
                                                    <td>1.6</td>
+
−
                                                    <td>0.037 (only two trials)</td>
+
−
                                                </tr>
+
−
                                                   
+
 
                                             </tbody>
 
                                             </tbody>
 
                                         </table>
 
                                         </table>
 
</div>
 
</div>
 +
 +
 +
 +
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/c9/LethHS2015_oxalicacidcurve.jpg" style="" width="600px" height="400px" class="bees img-responsive">
 +
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Bee trials:</b><br></p>
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Bee trials:</b><br></p>
  
−
<table class="table table-striped table-bordered"> <caption></caption>
+
 
 +
<table class="table table-striped table-bordered bees"> <caption></caption>
 
                                             <thead>
 
                                             <thead>
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
Line 414: Line 359:
 
                                             </tbody>
 
                                             </tbody>
 
                                         </table>
 
                                         </table>
−
<p>The bees will be able to survive all of the oxalic acid that the E.coli can produce.</p>
+
<p class="bees">The bees will be able to survive all of the oxalic acid that the E.coli can produce.</p>
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Mite trials:</b><br></p>
 
<p id="humanpractices_hp" class="bees"><b>Mite trials:</b><br></p>
−
<table class="table table-striped table-bordered"> <caption></caption>
+
<table class="table table-striped table-bordered bees"> <caption></caption>
 
                                             <thead>
 
                                             <thead>
 
                                                 <tr>
 
                                                 <tr>
Line 447: Line 392:
 
                                             </tbody>
 
                                             </tbody>
 
                                         </table>
 
                                         </table>
−
<p>The mites did not survive any of the trials.</p>
+
<p class="bees">The mites did not survive any of the trials.</p>
−
</section>
+
−
<section id="section2">
+
−
</section>
+
  
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/a/af/LethHS2015_5.png" width=300px height=300px class="img-responsive”>
+
 
−
</section>
+
<p id="humanpractices_hp" class="biofilms"><b>Antibiotics testing:</b><br></p>
−
<section id="section2">
+
<table class="table table-striped table-bordered biofilms"> <caption></caption>
−
</section>
+
                                            <thead>
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/1c/LethHS2015_6.jpg" width=300px height=300px class="img-responsive”>
+
                                                <tr>
−
</section>
+
                                                    <th>Test (Antibiotics)</th>
−
<section id="section2">
+
                                                    <th>Result</th>
−
</section>
+
<th>After</th>
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/48/LethHS2015_7.png" width=300px height=300px class="img-responsive”>
+
                                                </tr>
−
</section>
+
                                            </thead>
−
<section id="section2">
+
                                            <tbody>
−
</section>
+
                                                <tr>
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/c3/LethHS2015_8.jpg" width=300px height=300px class="img-responsive”>
+
                                                    <td>AMP 1</td>
−
</section>
+
                                                    <td>Positive</td>
−
<section id="section2">
+
                                                </tr>
−
</section>
+
                                                <tr>
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/fd/LethHS201510.png" width=250px height=300px class="img-responsive”>
+
                                                    <td>AMP 2</td>
−
</section>
+
                                                    <td>Positive</td>
−
<section id="section2">
+
<td>Wet and slow moving.</td>
−
</section>
+
                                                </tr>
−
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/d/d3/LethHS201511.png" width=250px height=300px class="img-responsive”>
+
                                                <tr>
 +
                                                    <td>CAM 1</td>
 +
                                                    <td>Positive</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <td>CAM 2</td>
 +
                                                    <td>Positive</td>
 +
                                                </tr>
 +
  <tr>
 +
                                                    <td>TET 1</td>
 +
                                                    <td>Positive</td>
 +
                                                </tr>  <tr>
 +
                                                    <td>TET 2</td>
 +
                                                    <td>Positive</td>
 +
                                                </tr>
 +
<tr>
 +
                                                    <td>Control (water)</td>
 +
                                                    <td>Positive</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                             
 +
 
 +
                                                   
 +
                                            </tbody>
 +
                                        </table>
 +
<p class="biofilms">The results we got for antibiotics testing show that biofilms can still be recultured even after being treated with antibiotics.</p>
 +
 
 +
<p class="biofilms"><b>Testing with cleaners</b></p>
 +
<table class="table table-striped table-bordered biofilms"> <caption></caption>
 +
                                            <thead>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <th>Cleaner</th>
 +
                                                    <th>Results</th>
 +
<th>After</th>
 +
                                                </tr>
 +
                                            </thead>
 +
                                            <tbody>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <td>Bleach</td>
 +
                                                    <td>-</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <td>Tilex</td>
 +
                                                    <td>3</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <td>Mr. Clean</td>
 +
                                                    <td>-</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                                <tr>
 +
                                                    <td>Fantastik</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                </tr>
 +
  <tr>
 +
                                                    <td>Truly</td>
 +
                                                    <td>2</td>
 +
                                                </tr>
 +
  <tr>
 +
                                                    <td>Windex</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                </tr>
 +
  <tr>
 +
                                                    <td>Lysol</td>
 +
                                                    <td>-</td>
 +
                                                </tr>
 +
  <tr>
 +
                                                    <td>GreenWorks</td>
 +
                                                    <td>1</td>
 +
                                                </tr>
 +
                                             
 +
 
 +
                                                   
 +
                                            </tbody>
 +
                                        </table>
 +
 
 +
 
 +
 
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="biofilms">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/a/af/LethHS2015_5.png" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>Biofilms fluorescent imaging under Typhoon</figcaption>
 +
</figure>
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="bees">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/1c/LethHS2015_6.jpg" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>Different concentration of oxalic acid 3 minutes into incubation time at RT</figcaption>
 +
</figure>
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="bees">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/48/LethHS2015_7.png" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>E. coli cultures under varying concentration of oxalic acid</figcaption>
 +
</figure>
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="bees">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/c3/LethHS2015_8.jpg" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>E. coli cultures under varying concentration of oxalic acid</figcaption>
 +
</figure>
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="bees">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/fd/LethHS201510.png" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>Microcentrifuge tube containing Honey Bee</figcaption>
 +
</figure>
 +
 
 +
<figure style=" margin-right:20px; float:left;" class="bees">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/d/d3/LethHS201511.png" width=400px height=300px class="img-responsive">
 +
<figcaption>Microcentrifuge tube containing Varroa mites</figcaption>
 +
</figure>
  
  

Latest revision as of 03:46, 19 September 2015

Results

What results did we get in the lab?

Results

Oxalic acid results:

Oxalic Acid Concentration (mg/mL) OD528
0.1 1.862
0.2 1.675
0.3 1.675
0.4 1.655
0.5 1.673
0.6 1.680
0.7 1.655
0.8 1.630
0.9 1.587
1.0 1.564

Bee trials:

Treatment Before After
None Somewhat lethargic. Drank when prompted. Appeared tired, but otherwise unaffected.
0.00% Most lethargic, did not eat when offered Wet and slow moving.
0.05% Very vigorous; ran around inside the tube. Fed. Very energetic. Unaffected by treatment.
0.2% Very vigorous; ran around inside the tube. Fed. Slightly less energetic than the 0.05% bee.

The bees will be able to survive all of the oxalic acid that the E.coli can produce.

Mite trials:

Control Oxalic Acid RFP
Parafilm Pouch Mites dead Mites dead Mites dead
Larvae 1 Mites dead Mites dead Mites dead
Larvae 2 Mites dead Mites dead Mites dead

The mites did not survive any of the trials.

Antibiotics testing:

Test (Antibiotics) Result After
AMP 1 Positive
AMP 2 Positive Wet and slow moving.
CAM 1 Positive
CAM 2 Positive
TET 1 Positive
TET 2 Positive
Control (water) Positive

The results we got for antibiotics testing show that biofilms can still be recultured even after being treated with antibiotics.

Testing with cleaners

Cleaner Results After
Bleach -
Tilex 3
Mr. Clean -
Fantastik 1
Truly 2
Windex 1
Lysol -
GreenWorks 1
Biofilms fluorescent imaging under Typhoon
Different concentration of oxalic acid 3 minutes into incubation time at RT
E. coli cultures under varying concentration of oxalic acid
E. coli cultures under varying concentration of oxalic acid
Microcentrifuge tube containing Honey Bee
Microcentrifuge tube containing Varroa mites