Difference between revisions of "Team:Bielefeld-CeBiTec/Media"

Line 133: Line 133:
 
             <div class="panel-heading">
 
             <div class="panel-heading">
 
                 <h4 class="panel-title">
 
                 <h4 class="panel-title">
                     <a data-toggle="collapse" href="#collapseFive">50X TAE Stock Solution</a>
+
                     <a data-toggle="collapse" href="#collapseFive">Equilibration buffer for lacI purification</a>
 
                 </h4>
 
                 </h4>
 
             </div>
 
             </div>
Line 141: Line 141:
 
                         <li>For each litre of solution: </li>
 
                         <li>For each litre of solution: </li>
 
                             <ul>  
 
                             <ul>  
                                 <li>242 g Tris Base (MW=121.1) </li>
+
                                 <li>29.22g NaCl </li>
                                 <li>57.1 ml Glacial Acetic Acid </li>
+
                                 <li>1.36 g imidazole </li>
                                 <li>100 ml 0.5 M EDTA </li>  
+
                                 <li>29 ml of 86 % glycerol </li>  
 
                             </ul> <br>
 
                             </ul> <br>
                                 <li>mix Tris with stir bar to dissolve in about 600 ml of ddH<sub>2</sub>O. </li>
+
                                 <li>Add all these ingredients to a 50 mM sodium phosphate buffer (pH 8.0). Prior to use add DTT to a final concentration of 1mM. </li>
                                <li>add the EDTA and Acetic Acid. </li>  
+
                                  
                                 <li>bring final volume to 1 l with ddH20. </li>
+
 
                                 <li>store at room temperature. </li> <br>
 
                                 <li>store at room temperature. </li> <br>
 
                                 <li>Note: Final (1x) working concentration: </li>
 
                                 <li>Note: Final (1x) working concentration: </li>
 
                                     <ul>  
 
                                     <ul>  
                                         <li>0.04 M Tris - Acetate </li>
+
                                         <li>50 mM sodium phosphate </li>
                                         <li>0.001 M EDTA </li>  
+
                                         <li>500 mM NaCl </li>
 +
                                        <li>20 mM imidazole</li>
 +
                                        <li>2.5 % glycerol </li>
 +
                                        <li>1 mM DTT</li>
 
                                     </ul>  
 
                                     </ul>  
 
                     </ul>
 
                     </ul>
Line 161: Line 163:
 
             <div class="panel-heading">
 
             <div class="panel-heading">
 
                 <h4 class="panel-title">
 
                 <h4 class="panel-title">
                     <a data-toggle="collapse" href="#collapseSix">50X TAE Stock Solution</a>
+
                     <a data-toggle="collapse" href="#collapseSix">Elution buffer for purification of lacI</a>
 
                 </h4>
 
                 </h4>
 
             </div>
 
             </div>
Line 169: Line 171:
 
                         <li>For each litre of solution: </li>
 
                         <li>For each litre of solution: </li>
 
                             <ul>  
 
                             <ul>  
                                 <li>242 g Tris Base (MW=121.1) </li>
+
                                 <li>17.53 g NaCl </li>
                                 <li>57.1 ml Glacial Acetic Acid </li>
+
                                 <li>13.6 g imidazole </li>
                                 <li>100 ml 0.5 M EDTA </li>
+
                                  
 
                             </ul> <br>
 
                             </ul> <br>
                                <li>mix Tris with stir bar to dissolve in about 600 ml of ddH<sub>2</sub>O. </li>
+
                        <li>Add all these ingredients to a 20 mM sodium phosphate buffer (pH 7.4). </li>
                                <li>add the EDTA and Acetic Acid. </li>
+
                                <li>bring final volume to 1 l with ddH20. </li>
+
 
                                 <li>store at room temperature. </li> <br>
 
                                 <li>store at room temperature. </li> <br>
 
                                 <li>Note: Final (1x) working concentration: </li>
 
                                 <li>Note: Final (1x) working concentration: </li>
 
                                     <ul>  
 
                                     <ul>  
                                         <li>0.04 M Tris - Acetate </li>
+
                                         <li>20 mM sodium phosphate</li>
                                         <li>0.001 M EDTA </li>  
+
                                         <li>300 mM NaCl </li>
 +
                                        <li>200 mM imidazole</li>
 +
                                    </ul>
 +
                    </ul>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </div>
 +
              <div class="panel panel-default">
 +
            <div class="panel-heading">
 +
                <h4 class="panel-title">
 +
                    <a data-toggle="collapse" href="#collapseSeven">Buffer for dialysis of lacI</a>
 +
                </h4>
 +
            </div>
 +
            <div id="collapseSeven" class="panel-collapse collapse">
 +
                <div class="panel-body">
 +
                    <ul>
 +
                        <li>For each litre of solution: </li>
 +
                            <ul>
 +
                                <li>50 g glucose </li>
 +
                               
 +
                            </ul> <br>
 +
                        <li>Add the glucose to a 200 mM potassium phosphate buffer (pH 7.6). Prior to usage add DTT to a final concentration of 1 mM</li>
 +
                                <li>store at room temperature. </li> <br>
 +
                                <li>Note: Final (1x) working concentration: </li>
 +
                                    <ul>
 +
                                        <li>200 mM potassium phosphate</li>
 +
                                        <li>5 % glucose </li>
 +
                                        <li>1 mM DTT</li>
 
                                     </ul>  
 
                                     </ul>  
 
                     </ul>
 
                     </ul>

Revision as of 20:17, 6 July 2015

iGEM Bielefeld 2015


Media

LB

  • For 1 liter LB:
    • 20 g LB powder
    • Fill the bottle with deionized H2O

  • For 1 liter LB-plates:
    • 18 g LB powder
    • 16 g Select Agar
    • Fill the bottle with deionized H2O

SOC

  • Add the following components for 900 ml of distilled H2O:
    • 20 g Trypton
    • 5 g Bacto Yeast Extract
    • 2 ml of 5 M NaCl
    • 2.5 ml of 1 M KCl
    • 10 ml of 1 M MgCl2
    • 10 ml of 1 M MgSO4
    • 20 ml of 1 M glucose

Buffers

  • For each litre of solution:
    • 242 g Tris Base (MW=121.1)
    • 57.1 ml Glacial Acetic Acid
    • 100 ml 0.5 M EDTA

  • mix Tris with stir bar to dissolve in about 600 ml of ddH2O.
  • add the EDTA and Acetic Acid.
  • bring final volume to 1 l with ddH20.
  • store at room temperature.

  • Note: Final (1x) working concentration:
    • 0.04 M Tris - Acetate
    • 0.001 M EDTA
  • For each 200 ml of solution:
    • 5.844 g NaCl
    • 0.272 g imidazole
    • 5.8 ml of 86 % glycerol
    • 0.406 g MgCl2
    • 0.2 g lysozyme

  • Add all these ingredients to a 50 mM sodium phosphate buffer (pH 8.0). Prior to use add DTT to a final concentration of 1mM and tween 20 to a final concentration of 0.1 %.
  • store at room temperature.

  • Note: Final (1x) working concentration:
    • 50 mM Sodiumphosphate
    • 500 mM NaCl
    • 20 mM imidazole
    • 2.5 % glxcerol
    • 1 mM DTT
    • 10 mM MgCl2
    • 0.1 % tween 20
    • 1 mg/ml lysozyme
  • For each litre of solution:
    • 29.22g NaCl
    • 1.36 g imidazole
    • 29 ml of 86 % glycerol

  • Add all these ingredients to a 50 mM sodium phosphate buffer (pH 8.0). Prior to use add DTT to a final concentration of 1mM.
  • store at room temperature.

  • Note: Final (1x) working concentration:
    • 50 mM sodium phosphate
    • 500 mM NaCl
    • 20 mM imidazole
    • 2.5 % glycerol
    • 1 mM DTT
  • For each litre of solution:
    • 17.53 g NaCl
    • 13.6 g imidazole

  • Add all these ingredients to a 20 mM sodium phosphate buffer (pH 7.4).
  • store at room temperature.

  • Note: Final (1x) working concentration:
    • 20 mM sodium phosphate
    • 300 mM NaCl
    • 200 mM imidazole
  • For each litre of solution:
    • 50 g glucose

  • Add the glucose to a 200 mM potassium phosphate buffer (pH 7.6). Prior to usage add DTT to a final concentration of 1 mM
  • store at room temperature.

  • Note: Final (1x) working concentration:
    • 200 mM potassium phosphate
    • 5 % glucose
    • 1 mM DTT