Difference between revisions of "Team:William and Mary"

Line 286: Line 286:
 
                     <!-- End Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
                     <!-- End Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
   
 
   
                        <!-- Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
                        <div class="section section-we-do-2" id="workflow2">
 
                            <div class="container">
 
                                <div class="row">
 
                                    <div class="title">
 
                                        <p class = "h2WM">Human practices</p>
 
                                    </div>
 
<p>Our Human Practices effort was a multi-faceted outreach approach to science literacy, focusing specifically on spreading a basic understanding of synthetic biology to the general public. We collaborated with numerous organizations (logos below) to host nine educational Synthetic Biology workshops for the public (from first graders to adults!) and to implement our original, 24-activity Synthetic Biology curriculum into schools worldwide, to further sustain our efforts for years to come.  </p>
 
                                    <div class="col-md-10 col-md-offset-1">
 
                                        <div class="row">
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Adult Communication</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/0/07/WMBooksIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Youth Education</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3e/WMTimeIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Long-Term Sustainability</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3e/WMTimeIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Long-Term Sustainability</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3e/WMTimeIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Long-Term Sustainability</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                            <div class="col-md-4">
 
                                                <div class="card">
 
                                                    <div class="icon">
 
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3e/WMTimeIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                    </div>
 
                                                    <h3>Long-Term Sustainability</h3>
 
                                                </div>
 
                                            </div>
 
                                        </div>
 
                                    </div>
 
                                </div>
 
                            </div>
 
                        </div>
 
                        <!-- End Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
 
 
                         <!-- Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
                         <!-- Section "What We do" example 3: Small Title & 3 columns icons -->
 
                         <div class="section section-we-do-2" id="workflow2">
 
                         <div class="section section-we-do-2" id="workflow2">
Line 358: Line 293:
 
                                         <p class = "h2WM">Human Practices</p>
 
                                         <p class = "h2WM">Human Practices</p>
 
                                     </div>
 
                                     </div>
<p>Our Human Practices effort was a multi-faceted outreach approach to science literacy, focusing specifically on spreading a basic understanding of synthetic biology to the general public. We collaborated with numerous organizations (logos below) to host nine educational Synthetic Biology workshops for the public (from first graders to adults!) and to implement our original, 24-activity Synthetic Biology curriculum into schools worldwide, to further sustain our efforts for years to come.  </p>
+
<p>Our Human Practices effort was a multi-faceted outreach approach to science literacy, focusing specifically on spreading a basic understanding of synthetic biology to the general public. We collaborated with numerous organizations (logos below) to host nine educational Synthetic Biology workshops for the public (from first graders to adults!) and to implement our original, 24-activity Synthetic Biology curriculum into schools worldwide, to further sustain our efforts for years to come. Along the way, we worked with several schools and organizationsWe've listed some of their logos below.</p>
 
                                     <div class="col-md-10 col-md-offset-1">
 
                                     <div class="col-md-10 col-md-offset-1">
 
                                         <div class="row">
 
                                         <div class="row">
Line 364: Line 299:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/c1/WmL1.png" height= "100"/>
                                                    </div>
+
                                                </div>
+
                                            </div>
+
                                            <div class="col-md-3">
+
                                                <div class="card">
+
                                                    <div class="icon">
+
                                                        <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 378: Line 306:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/4a/Wml2.png" height= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 385: Line 313:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/e/e8/Wml3.png" height= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 392: Line 320:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/ff/WMl4.png" height= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 399: Line 327:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/20/WMl5.png" height= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 406: Line 334:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/b/b4/WMl6.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 413: Line 341:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/f6/WMl7.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 420: Line 348:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/36/Wml8.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 427: Line 355:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/19/Wml9.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 434: Line 362:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/17/Wml10.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 441: Line 369:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/cd/Wml11.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>
Line 448: Line 376:
 
                                                 <div class="card">
 
                                                 <div class="card">
 
                                                     <div class="icon">
 
                                                     <div class="icon">
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/28/WMSpeechIconColor.png" height= "100" width= "100"/>
+
                                                         <img alt="..." src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/a/aa/Wml12.png" height= "100" width= "100"/>
 
                                                     </div>
 
                                                     </div>
 
                                                 </div>
 
                                                 </div>

Revision as of 01:43, 19 September 2015

NOISE - W&M iGEM

NOISE

Characterization of promoter-derived transcriptional noise in E. coli

Parts

In deciding which parts to submit to the iGEM Registry we focused on three main aspects.

First: ensuring our project is as reproducible and extensible as possible. To that end we have submitted all of new composite fluorescent protein parts that we constructed during the project. Second: Making genome integration as straightforward as possible for iGEM teams. In order to accomplish this goal we designed, tested, and validated a new integrator cassette that allows for simple genome integration using either 3A or Gibson Assembly. Third: Increasing the number of tools available for promoter-mediated regulation in synthetic biology. We created and validated an E. coli codon optimized dCas9 variant and a suite of gRNAs to target the most commonly used promoters in iGEM.

Measurement & Modeling

We measured noise in fluorescence data for dual-integrated sets of CFP and YFP under three promoters: BBa_R0010, BBa_R0011, and BBa_R0051. We also developed an analytic model of the impact of plasmid copy number fluctuations on transcriptional noise, which revealed that intrinsic noise cannot be accurately measured from reporters on the pSB1X3 plasmid series.

Human Practices

Our Human Practices effort was a multi-faceted outreach approach to science literacy, focusing specifically on spreading a basic understanding of synthetic biology to the general public. We collaborated with numerous organizations (logos below) to host nine educational Synthetic Biology workshops for the public (from first graders to adults!) and to implement our original, 24-activity Synthetic Biology curriculum into schools worldwide, to further sustain our efforts for years to come. Along the way, we worked with several schools and organizations. We've listed some of their logos below.

...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...
...

Team

Noise, one promoter at a time.

...