Difference between revisions of "Team:Stanford-Brown/CRATER"
| Line 82: | Line 82: | ||
<div class="jumbotron oridomiLeft"> | <div class="jumbotron oridomiLeft"> | ||
<div class="container"> | <div class="container"> | ||
| − | <h1>Welcome to CRATER<small> Method for More Efficient Bacterial Transformations <small></h1> | + | <h1>Welcome to CRATER<small> <br> Method for More Efficient Bacterial Transformations <small></h1> |
</div> | </div> | ||
</div> | </div> | ||
Revision as of 04:25, 14 September 2015
Welcome to CRATER
Method for More Efficient Bacterial Transformations
Abstract
The CRISPR/Cas9 system has revolutionized genome editing by providing unprecedented DNA-targeting specificity. Here we demonstrate that this system can be applied to facilitate efficient plasmid selection for transformation as well as selective gene insertion into plasmid vectors by cleaving unwanted plasmid byproducts after restriction enzyme digestion and ligation. Using fluorescent and chromogenic proteins as reporters, we demonstrate that CRISPR/Cas9 cleavage excludes unwanted ligation byproducts and increases transformation efficiency of desired inserts from 20% up to 97% ± 3%. This CRISPR/Cas9-Assisted Transformation-Efficient Reaction (CRATER) protocol is a novel, inexpensive, and convenient method for obtaining specific cloning products.
See our BioBricksIntroduction with the following projects below
Donec ullamcorper nulla non metus auctor fringilla. Vestibulum id ligula porta felis euismod semper. Praesent commodo cursus magna, vel scelerisque nisl consectetur. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo.
Donec tincidunt aliquet justo, sit amet mollis purus varius ac. Quisque ac sapien eu ante convallis cursus congue vel odio. Sed efficitur sapien ut eros sodales ornare. Vestibulum pellentesque lorem sed nulla interdum, non tincidunt velit sagittis. Vestibulum cursus, enim eu porta euismod, enim lectus facilisis diam, at sodales metus ligula sit amet eros. Sed ullamcorper, mauris nec mollis pretium, justo ligula dapibus nulla, non elementum nisl libero ut elit. Proin mi urna, finibus at scelerisque quis, porttitor at mauris. Nulla laoreet venenatis cursus. Vivamus et pellentesque quam, eget malesuada ex. Quisque eu massa ligula. Nam interdum dui sed laoreet efficitur. Aliquam sed vulputate orci. Pellentesque sed sollicitudin lectus. Vivamus nec tortor risus. Vestibulum malesuada feugiat lorem a dignissim. In diam mauris, venenatis at vulputate eget, venenatis sit amet metus. Suspendisse ut mi in ipsum sagittis malesuada at nec erat. Etiam volutpat risus quis nisi hendrerit porttitor vel eu tortor. Donec venenatis, risus sit amet ullamcorper scelerisque, tellus erat consequat nibh, vel dictum velit augue id leo. In eleifend tristique ipsum sed dignissim. Duis mattis, ipsum nec aliquet varius, turpis orci tempus nulla, in sodales libero massa at diam. Nulla maximus eros sed venenatis congue. Phasellus diam nunc, ullamcorper vitae tempor eget, sagittis eu odio. Praesent a mauris porttitor, mattis sem a, sodales massa. Proin et justo lectus. Proin varius magna ac leo ullamcorper accumsan. Proin id diam eget dolor vulputate mattis. Suspendisse pellentesque, nunc sit amet blandit feugiat, risus eros egestas massa, nec condimentum ante sapien ac velit. Vivamus efficitur justo dolor, at gravida lorem venenatis at. Aenean at ligula sapien. Mauris eget eleifend justo, eget faucibus ante. Ut mattis ante vitae dignissim maximus. Integer feugiat arcu purus, a viverra dui elementum vitae. Phasellus mattis porttitor iaculis. In eu nisi eu augue lacinia fringilla venenatis at nunc. Nam est erat, hendrerit ac dignissim sed, mollis eu eros.
Experiment Engineering E. coli to produce polystyrene
Donec ullamcorper nulla non metus auctor fringilla. Vestibulum id ligula porta felis euismod semper. Praesent commodo cursus magna, vel scelerisque nisl consectetur. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo.
Donec tincidunt aliquet justo, sit amet mollis purus varius ac. Quisque ac sapien eu ante convallis cursus congue vel odio. Sed efficitur sapien ut eros sodales ornare. Vestibulum pellentesque lorem sed nulla interdum, non tincidunt velit sagittis. Vestibulum cursus, enim eu porta euismod, enim lectus facilisis diam, at sodales metus ligula sit amet eros. Sed ullamcorper, mauris nec mollis pretium, justo ligula dapibus nulla, non elementum nisl libero ut elit. Proin mi urna, finibus at scelerisque quis, porttitor at mauris. Nulla laoreet venenatis cursus. Vivamus et pellentesque quam, eget malesuada ex. Quisque eu massa ligula. Nam interdum dui sed laoreet efficitur. Aliquam sed vulputate orci. Pellentesque sed sollicitudin lectus. Vivamus nec tortor risus. Vestibulum malesuada feugiat lorem a dignissim. In diam mauris, venenatis at vulputate eget, venenatis sit amet metus. Suspendisse ut mi in ipsum sagittis malesuada at nec erat. Etiam volutpat risus quis nisi hendrerit porttitor vel eu tortor. Donec venenatis, risus sit amet ullamcorper scelerisque, tellus erat consequat nibh, vel dictum velit augue id leo. In eleifend tristique ipsum sed dignissim. Duis mattis, ipsum nec aliquet varius, turpis orci tempus nulla, in sodales libero massa at diam. Nulla maximus eros sed venenatis congue. Phasellus diam nunc, ullamcorper vitae tempor eget, sagittis eu odio. Praesent a mauris porttitor, mattis sem a, sodales massa. Proin et justo lectus. Proin varius magna ac leo ullamcorper accumsan. Proin id diam eget dolor vulputate mattis. Suspendisse pellentesque, nunc sit amet blandit feugiat, risus eros egestas massa, nec condimentum ante sapien ac velit. Vivamus efficitur justo dolor, at gravida lorem venenatis at. Aenean at ligula sapien. Mauris eget eleifend justo, eget faucibus ante. Ut mattis ante vitae dignissim maximus. Integer feugiat arcu purus, a viverra dui elementum vitae. Phasellus mattis porttitor iaculis. In eu nisi eu augue lacinia fringilla venenatis at nunc. Nam est erat, hendrerit ac dignissim sed, mollis eu eros. Morbi vel egestas dui, consectetur posuere nisi. Aliquam vitae tortor vulputate, fringilla est vel, faucibus diam. Suspendisse potenti. Donec sed commodo nulla. Duis feugiat, diam eu pulvinar rhoncus, arcu erat pretium orci, ut porta diam elit eu mi. Etiam eros massa, egestas eu mattis id, hendrerit at ligula. Duis placerat felis nec risus volutpat lobortis. Sed elementum, dolor non feugiat placerat, libero sapien pharetra diam, sed faucibus est ex tristique sem. Vivamus rutrum libero eget mollis sodales. Pellentesque vel scelerisque felis, a imperdiet erat. Fusce quis nisl magna. Sed non libero ultrices sapien hendrerit suscipit aliquet convallis leo. Quisque nec aliquam libero, in commodo ex. In eget nulla consequat, commodo quam id, hendrerit velit. Vestibulum non interdum enim. Ut elit justo, suscipit vel pretium vitae, rutrum sed dui. Donec vehicula sit amet ex ac finibus. Donec ultrices tellus et laoreet dictum.
Data and Results Optimizing the production of biological PHA
Donec ullamcorper nulla non metus auctor fringilla. Vestibulum id ligula porta felis euismod semper. Praesent commodo cursus magna, vel scelerisque nisl consectetur. Fusce dapibus, tellus ac cursus commodo.
Donec tincidunt aliquet justo, sit amet mollis purus varius ac. Quisque ac sapien eu ante convallis cursus congue vel odio. Sed efficitur sapien ut eros sodales ornare. Vestibulum pellentesque lorem sed nulla interdum, non tincidunt velit sagittis. Vestibulum cursus, enim eu porta euismod, enim lectus facilisis diam, at sodales metus ligula sit amet eros. Sed ullamcorper, mauris nec mollis pretium, justo ligula dapibus nulla, non elementum nisl libero ut elit. Proin mi urna, finibus at scelerisque quis, porttitor at mauris. Nulla laoreet venenatis cursus. Vivamus et pellentesque quam, eget malesuada ex. Quisque eu massa ligula. Nam interdum dui sed laoreet efficitur. Aliquam sed vulputate orci. Pellentesque sed sollicitudin lectus. Vivamus nec tortor risus. Vestibulum malesuada feugiat lorem a dignissim. In diam mauris, venenatis at vulputate eget, venenatis sit amet metus. Suspendisse ut mi in ipsum sagittis malesuada at nec erat. Etiam volutpat risus quis nisi hendrerit porttitor vel eu tortor. Donec venenatis, risus sit amet ullamcorper scelerisque, tellus erat consequat nibh, vel dictum velit augue id leo. In eleifend tristique ipsum sed dignissim. Duis mattis, ipsum nec aliquet varius, turpis orci tempus nulla, in sodales libero massa at diam. Nulla maximus eros sed venenatis congue. Phasellus diam nunc, ullamcorper vitae tempor eget, sagittis eu odio. Praesent a mauris porttitor, mattis sem a, sodales massa. Proin et justo lectus. Proin varius magna ac leo ullamcorper accumsan. Proin id diam eget dolor vulputate mattis. Suspendisse pellentesque, nunc sit amet blandit feugiat, risus eros egestas massa, nec condimentum ante sapien ac velit. Vivamus efficitur justo dolor, at gravida lorem venenatis at. Aenean at ligula sapien. Mauris eget eleifend justo, eget faucibus ante. Ut mattis ante vitae dignissim maximus. Integer feugiat arcu purus, a viverra dui elementum vitae. Phasellus mattis porttitor iaculis. In eu nisi eu augue lacinia fringilla venenatis at nunc. Nam est erat, hendrerit ac dignissim sed, mollis eu eros. Morbi vel egestas dui, consectetur posuere nisi. Aliquam vitae tortor vulputate, fringilla est vel, faucibus diam. Suspendisse potenti. Donec sed commodo nulla. Duis feugiat, diam eu pulvinar rhoncus, arcu erat pretium orci, ut porta diam elit eu mi. Etiam eros massa, egestas eu mattis id, hendrerit at ligula. Duis placerat felis nec risus volutpat lobortis. Sed elementum, dolor non feugiat placerat, libero sapien pharetra diam, sed faucibus est ex tristique sem. Vivamus rutrum libero eget mollis sodales. Pellentesque vel scelerisque felis, a imperdiet erat. Fusce quis nisl magna. Sed non libero ultrices sapien hendrerit suscipit aliquet convallis leo. Quisque nec aliquam libero, in commodo ex. In eget nulla consequat, commodo quam id, hendrerit velit. Vestibulum non interdum enim. Ut elit justo, suscipit vel pretium vitae, rutrum sed dui. Donec vehicula sit amet ex ac finibus. Donec ultrices tellus et laoreet dictum.
See our Picture Gallery!Protocols
Vestibulum nec nisl eu ex ullamcorper mattis ac vel tortor.
Duis nec nibh non nisl tristique condimentum quis eu leo.
Sed venenatis massa in tortor gravida dictum.
Nam sollicitudin enim ac egestas fermentum. Suspendisse tempor urna vel mollis mollis. Proin ac mauris facilisis sapien maximus suscipit nec eget felis. Fusce ac urna sit amet nunc condimentum gravida. Aenean commodo nunc et tempus egestas. Suspendisse cursus quam placerat, vestibulum nunc non, imperdiet felis. Curabitur et erat non justo eleifend commodo. In sit amet sem vitae eros placerat facilisis. Quisque eget ligula vel tellus fermentum vestibulum. Curabitur eu ligula non lorem pulvinar posuere ac commodo ante. Sed convallis quam ut risus dignissim, nec pellentesque risus malesuada. Vestibulum vel sem eu tortor ornare consequat ac eget ligula. Suspendisse eu lacus ut nisi aliquet mollis id nec eros. Integer vulputate sem sed massa porta, eget dapibus odio pellentesque. Morbi sit amet lacus quis urna mattis elementum. See our Lab Notebook!References
Vestibulum nec nisl eu ex ullamcorper mattis ac vel tortor. Duis nec nibh non nisl tristique condimentum quis eu leo. Sed venenatis massa in tortor gravida dictum. Nam sollicitudin enim ac egestas fermentum. Suspendisse tempor urna vel mollis mollis. Proin ac mauris facilisis sapien maximus suscipit nec eget felis. Fusce ac urna sit amet nunc condimentum gravida. Aenean commodo nunc et tempus egestas. Suspendisse cursus quam placerat, vestibulum nunc non, imperdiet felis. Curabitur et erat non justo eleifend commodo. In sit amet sem vitae eros placerat facilisis. Quisque eget ligula vel tellus fermentum vestibulum.p>