Difference between revisions of "Team:Aix-Marseille/Software"

 
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−
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+
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−
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+
−
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+
 
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         <script type="text/javascript" src="https://2015.igem.org/Team:NRP-UEA-Norwich/bootstrap.js?action=raw&ctype=text/javascript"></script>
−
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         <!--[if lt IE 7]>
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 +
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text-shadow: 0px 0px 10px rgba(150, 150, 150, 1), 0px 0px 10px rgba(150, 150, 150, 1), 0px 0px 10px rgba(150, 150, 150, 1), 0px 0px 10px rgba(150, 150, 150, 1);
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<link rel="stylesheet" href="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/animate.css/3.4.0/animate.min.css">
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<body>
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+
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                             <div class="collapse navbar-collapse  " id="bs-example-navbar-collapse-1">
 
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−
                                 <li><a href="/Team:Aix Marseille"  class="logo"><img src="http://i.imgur.com/x0P5Rs4.png" class="img-responsive" width="80" height="80"></a></li>
+
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                                     <li  ><a href="/Team:Aix-Marseille">Home</a></li>
 
                                     <li  ><a href="/Team:Aix-Marseille">Home</a></li>
 
                                       <li class="dropdown " id="dropdown"><a href="#" class="dropdown-toggle"  data-toggle="dropdown">Project</a>
 
                                       <li class="dropdown " id="dropdown"><a href="#" class="dropdown-toggle"  data-toggle="dropdown">Project</a>
 
                                       <ul class="dropdown-menu">
 
                                       <ul class="dropdown-menu">
−
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Project">Background</a></li>
+
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Project/Description">Overview</a></li>
−
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Project design">Project design</a></li>
+
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Design">Project design</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Parts">Parts</a></li>                                   
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Parts">Parts</a></li>                                   
 
                                       </ul>
 
                                       </ul>
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                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Team">Members</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Team">Members</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Supervisors">Supervisors</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Supervisors">Supervisors</a></li>
−
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Collaboration">Collaboration</a></li>  
+
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Collaborations">Collaborations</a></li>  
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Attributions">Attributions</a></li>                                   
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Attributions">Attributions</a></li>                                   
 
                                       </ul>
 
                                       </ul>
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                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Protocols">Protocols</a></li>                                   
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Protocols">Protocols</a></li>                                   
 
                                       </ul>
 
                                       </ul>
−
                                     <li  ><a href="/Team:Aix-Marseille/Human/Practices">Human Practices</a></li>                                    
+
 
−
                                     <li class="dropdown " id="dropdown"><a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">Measurement</a>
+
                                     <li  ><a href="/Team:Aix-Marseille/Practices">Practices</a></li>  
 +
                                 
 +
                                     <li class="dropdown " id="dropdown"><a href="#" class="dropdown-toggle" data-toggle="dropdown">Interlab Study</a>
 
                                       <ul class="dropdown-menu">
 
                                       <ul class="dropdown-menu">
 +
                                        <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Notebook2">Calendar</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Measurement">Results</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Measurement">Results</a></li>
−
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Protocols">Protocols</a></li>
+
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Protocols2">Protocols</a></li>
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Sequencing/data">Sequencing data</a></li>                                   
 
                                         <li ><a href="/Team:Aix-Marseille/Sequencing/data">Sequencing data</a></li>                                   
 
                                       </ul>
 
                                       </ul>
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                                       </ul>     
 
                                       </ul>     
 
                                     </li>
 
                                     </li>
−
                        
+
                       <li class="dropdown " id="dropdown"><a href="/Team:Aix-Marseille/Achievement" class="dropdown-toggle"  data-toggle="dropdown">Achievement</a></li>
 
                                   </li>
 
                                   </li>
  
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     </header>
 
     </header>
  
−
        <div class="clearfix"></div>
+
 
 +
    <!-- end hearo section -->
 +
 
 +
    <div class="clearfix"></div>
 
       <!-- start project section -->
 
       <!-- start project section -->
−
    <section id="project" style="padding:50px 0px 15px;">
+
    <section style="padding:30px 0px 50px;" class="arrow_box" id="team">
 
    
 
    
 
     <div class="container">
 
     <div class="container">
 
     <div class="row">
 
     <div class="row">
 
     <div class="col-md-6 left">
 
     <div class="col-md-6 left">
−
     <h1 class="title1">Software</h2>
+
     <h2 class="title wow Hinge"><span style="color:#8E3B8C"><span style="font-family:Armalite rifle">Software : <b>« Linker Generator 1.0 »</b></h2></span></span>
 
     <div class="space30"></div>
 
     <div class="space30"></div>
−
    
+
     <p class="space20"><div align="justify"><span style="font-family:courier new">We have developed a computer tool called « Linker Generator 1.0 ». We are pleased to present it to you. This software allows you to determine the linkers for fusion proteins. Its interface is shown below. </span>
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 +
<p><span style="font-family:courier new">To use it, you just have to follow the instructions in three steps :</p></span>
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<ul>
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<span style="font-family:courier new"><li>1) install pyton (https://www.python.org/downloads/)</li></span>
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<span style="font-family:courier new"><li>2) download the script (https://github.com/gwils28/LinkerG)</li></span>
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<span style="font-family:courier new"><li>3) run it</li></span>
 +
</div></p>
 +
 
  
 
     </div>
 
     </div>
−
     <div class="col-md-5 col-md-offset-1  col-sm-offset-1  space30">
+
     <div class="col-md-6 left">
−
                     <div class="success-work project">
+
                      
−
                       
+
                             <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/fd/Software.png" class="img-responsive" width="600" height="600">
−
                             <img src="IMAGE" href="IMAGE" alt="..." class="img-responsive mautomargin fancybox" style="cursor: pointer;">
+
                         
 
                          
 
                          
 +
                        </div>
 
                          
 
                          
 
                     </div>
 
                     </div>
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     </div>
 
     </div>
 
     </div>
 
     </div>
−
           
+
            <div class="space30"></div>
 
     </div>
 
     </div>
  
 
     </section>
 
     </section>
 +
    <div class="clearfix"></div>
  
  
  
−
       <!-- start science section -->
+
     
−
     <section style="padding:10px 0px 0px;">
+
 
 +
 +
       <!-- start social section -->
 +
     <section style="padding:50px 0px;" class="arrow_box" id="ethics">
 
    
 
    
 
     <div class="container">
 
     <div class="container">
 
     <div class="row">
 
     <div class="row">
−
     <div class="col-md-12 left">
+
     <div class="col-md-12 text-center">
 +
<h1 class="blue">MORE INFORMATION ON FACEBOOK !</h1>
 +
                    <ul class="list-inline space80 icon">
 +
                        <li><a href="https://www.facebook.com/iGEM.AMU?fref=ts"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/e/ed/FacebookAMU.png" width="200" height="200" class="img-grey mautomargin"></a></li>
 +
                    </ul>
  
−
 
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                </div>
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     </div>
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    </div>
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    <div class="col-md-5 col-md-offset-1  col-sm-offset-1  space30">
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                    <div class="success-work project">
+
−
                       
+
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                          <img src="IMAGE" href="IMAGE" alt="..." class="img-responsive mautomargin fancybox" style="cursor: pointer;">
+
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    <div class="col-md-5 col-md-offset-1  col-sm-offset-1 space30 text-center">
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                    <div class="success-work science">
+
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                        <img src="http://i.imgur.com/Rl286Fc.jpg" class="img-responsive">
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+
 
       <!-- start sponsors section -->
 
       <!-- start sponsors section -->
−
<section style="padding:50px 0px; background: #f4f4f4;" class="arrow_box-test">
+
<section style="padding:50px 0px;" class="arrow_box-2">
 
          
 
          
 
         <div class="container">
 
         <div class="container">
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                 <div class="col-md-12 text-center">
 
                     <h2 class="gray">SPONSORS</h2>
 
                     <h2 class="gray">SPONSORS</h2>
−
                    <ul class="list-inline space30 icon">
+
<ul class="list-inline space30 icon">
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/iLFZ36R.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
+
  <li><a href="https://www.corning.com/worldwide/en/products/life-sciences.html">
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/KlP5G8h.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
+
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/8/87/Corninglogo.jpg" width="200" align="center"
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/EcfF9Kw.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
+
    class="img-grey mautomargin"></a></li>
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/IaWMSIr.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
  <li><a href="http://www.crous-aix-marseille.fr/social/fsdie-social">
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/ryVz5vv.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/18/KlP5G8h.jpg"  
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/ycgjpR7.jpg" width="225" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    class="img-grey mautomargin" width="200" align="center"></a></li>
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/GK5IMdz.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
  <li><a href="http://www.cnrs.fr/">
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/jUjj2YD.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/8/8e/CNRSlogo.jpg"
−
                        <li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/wjZ6U1A.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    width="200" class="img-grey mautomargin" align="center"></a></li>
−
<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/apuJ5in.jpg" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
  <li><a href="https://www.qiagen.com/fr/">
−
<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/5tokNzS.png" width="200" height="100" class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/f/f1/Qialogo.jpg" width="200" align="center"
−
<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/4jXkcLB.jpg" width="200" height="100"class="img-grey mautomargin"></a></li>
+
    class="img-grey mautomargin"></a></li>
−
<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/PUNXaNj.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
+
  <li><a href="http://www.univ-amu.fr/">
−
<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/SsgB8IC.jpg" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/38/EcfFf9Kw.png"  
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<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/m3ieC2R.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
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    class="img-grey mautomargin" width="200" align="center" ></a></li>
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<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/ll3uagr.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
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  <li><a href="http://polytech.univ-amu.fr/">
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<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/FtFgEFj.png" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/10/ILFZ36R.png"  
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<li><a href="#"><img src="http://i.imgur.com/ocgTw7q.jpg" class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
+
    class="img-grey mautomargin" width="200" align="center"></a></li>
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  <li><a href="http://www.grandluminy.com/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/6/66/GandLlogo.jpg" width="200" align="center"
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                    </ul>
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    class="img-grey mautomargin"></a></li>
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  <li><a href="https://www.eppendorf.com/FR-fr/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/d/db/Eppendorflogo.jpg" width="200" align="center"
 +
    class="img-grey mautomargin"></a></li>
 +
  <li><a href="http://www.dutscher.com/frontoffice/home">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/10/Deutcherflogo.jpg" width="200" align="center"
 +
    class="img-grey mautomargin"></a></li>
 +
  <li><a href="http://www.mn-net.com/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/1b/MNlogo.jpg" width="200" align="center"
 +
    class="img-grey mautomargin"></a></li>
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  <li><a href="https://fr.groupeonet.com/Onet-Proprete-et-Services">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/3/3d/5tokNzS.jpg" width="200" align="center"
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    class="img-grey mautomargin"></a></li>
 +
  <li><a href="http://www3.gehealthcare.fr/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/b/bd/GEHlogo.jpg" width="200"  
 +
    class="img-grey mautomargin" align="center" ></a></li>
 +
  <li><a href="https://www.sigmaaldrich.com/france.html">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/41/PUNXaNj.jpg" align="center"
 +
    class="img-grey mautomargin" width="200"></a></li>
 +
  <li><a href="http://www.starlab.de/int/?l=5">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/1/13/StarLablogo.jpg" align="center"
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    class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
 +
  <li><a href="http://fr.ambafrance-us.org/">
 +
    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/2/2b/M3ieC2R.jpg" align="center"
 +
    class="img-grey mautomargin" width="200" height="100"></a></li>
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  <li><a href="https://www.neb.com/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/a/a9/Ll3uagr.jpg" align="center"
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  <li><a href="http://sciences.univ-amu.fr/">
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    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/4/4a/FtFgEFj.jpg" align="center"
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  <li><a href="https://eu.idtdna.com/site">
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                         <p class="fsize18 space10">Chew figth project, for the iGEM competition. See you soon in Boston !</p>
 
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Latest revision as of 00:07, 19 September 2015

Chew fight

Software : « Linker Generator 1.0 »

We have developed a computer tool called « Linker Generator 1.0 ». We are pleased to present it to you. This software allows you to determine the linkers for fusion proteins. Its interface is shown below.

To use it, you just have to follow the instructions in three steps :

  • 1) install pyton (https://www.python.org/downloads/)
    •
  • 2) download the script (https://github.com/gwils28/LinkerG)
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  • 3) run it
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Chew figth project, for the iGEM competition. See you soon in Boston !